RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439009.1

LINC00578-201, long intergenic non-protein coding RNA 578, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC00578, Length 542 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00578-201ENST00000439009 ALX3O95076 343 aa6.55□□□□□ -1.36
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LINC00578-201ENST00000439009 LZICQ8WZA0 190 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00578-201ENST00000439009 ERGIC1Q969X5 290 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00578-201ENST00000439009 RASD2Q96D21 266 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00578-201ENST00000439009 NRBF2Q96F24 287 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00578-201ENST00000439009 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00578-201ENST00000439009 ACOXLQ9NUZ1 547 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00578-201ENST00000439009 ATPIF1Q9UII2 106 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00578-201ENST00000439009 V9GYQ6 96 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00578-201ENST00000439009 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00578-201ENST00000439009 IQCF6A8MYZ5 107 aa6.53□□□□□ -1.36
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LINC00578-201ENST00000439009 SGCEO43556 437 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00578-201ENST00000439009 DOK2O60496 412 aa6.53□□□□□ -1.36
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