RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NIPAL2Q9H841 368 aa14.77□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GMPPBQ9Y5P6 360 aa14.77□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A0A096LNT2 108 aa14.76□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa14.76□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PHYHO14832 338 aa14.76□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDC14BO60729 498 aa14.76□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COL8A2P25067 703 aa14.76□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CRYBB2P43320 205 aa14.76□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HCCSP53701 268 aa14.76□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF92Q03936 586 aa14.76□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMED1Q13445 227 aa14.76□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RIN1Q13671 783 aa14.76□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DEGS2Q6QHC5 323 aa14.76□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 Q6ZR03 302 aa14.76□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM57BQ71RH2 274 aa14.76□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC35F2Q8IXU6 374 aa14.76□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR51G2Q8NGK0 314 aa14.76□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR13G1Q8NGZ3 307 aa14.76□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR2AE1Q8NHA4 323 aa14.76□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 YIPF5Q969M3 257 aa14.76□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RDH12Q96NR8 316 aa14.76□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADGRL4Q9HBW9 690 aa14.76□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BRD7Q9NPI1 651 aa14.76□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C8orf4Q9NR00 106 aa14.76□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRP12Q9Y561 859 aa14.76□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GGT3PA6NGU5 568 aa14.75□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa14.75□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HEXAP06865 529 aa14.75□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SBK2P0C263 348 aa14.75□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATP6V1E1P36543 226 aa14.75□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRSS12P56730 875 aa14.75□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM33P57088 247 aa14.75□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TIGD6Q17RP2 521 aa14.75□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HFEQ30201 348 aa14.75□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PGAM5Q96HS1 289 aa14.75□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR8B4Q96RC9 309 aa14.75□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.75□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR10A2Q9H208 303 aa14.75□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLN6Q9NWW5 311 aa14.75□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IKZF2Q9UKS7 526 aa14.75□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COPS3Q9UNS2 423 aa14.75□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa14.74□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 E9PQ18 207 aa14.74□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF254O75437 659 aa14.74□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RP2O75695 350 aa14.74□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LY6G6DO95868 133 aa14.74□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TNFRSF1AP19438 455 aa14.74□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANOS1P23352 680 aa14.74□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CFL1P23528 166 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CXCR4P61073 352 aa14.74□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ROM1Q03395 351 aa14.74□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRC36Q1X8D7 754 aa14.74□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MEDAGQ5VYS4 303 aa14.74□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.74□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR10AD1Q8NGE0 317 aa14.74□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPSB4Q96A44 273 aa14.74□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TTTY10Q9BZA0 68 aa14.74□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM100Q9NV29 134 aa14.74□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IL19Q9UHD0 177 aa14.74□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C5orf63A6NC05 138 aa14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SNTNA6NMZ2 147 aa14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CD300LBA8K4G0 201 aa14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLDN25C9JDP6 229 aa14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PSMD9O00233 223 aa14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPIHO43447 177 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MPZL2O60487 215 aa14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PEX2P28328 305 aa14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHN2P52757 468 aa14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RIDAP52758 137 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM249Q2WGJ8 235 aa14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GFOD2Q3B7J2 385 aa14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC25A30Q5SVS4 291 aa14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LPCAT4Q643R3 524 aa14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF679Q8IYX0 411 aa14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GALNT4Q8N4A0 578 aa14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PACRGLQ8N7B6 248 aa14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF555Q8NEP9 628 aa14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCL17Q92583 94 aa14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UBE2FQ969M7 185 aa14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 REEP6Q96HR9 211 aa14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR2V2Q96R30 315 aa14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC22A4Q9H015 551 aa14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RGCCQ9H4X1 137 aa14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM118AQ9NWS6 357 aa14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RTTNQ86VV8 2226 aa14.73□□□□□ -0.05
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LILRA1O75019 489 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms