RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 GPRIN2O60269 458 aa25.58■■□□□ 1.69
ECHS1-201ENST00000368547 CRYAAP02489 173 aa25.58■■□□□ 1.69
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF35P13682 527 aa25.58■■□□□ 1.69
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
ECHS1-201ENST00000368547 CALCRP30988 508 aa25.58■■□□□ 1.69
ECHS1-201ENST00000368547 FABP5Q01469 135 aa25.58■■□□□ 1.69
ECHS1-201ENST00000368547 SPOCK1Q08629 439 aa25.58■■□□□ 1.69
ECHS1-201ENST00000368547 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa25.58■■□□□ 1.69
ECHS1-201ENST00000368547 TMED9Q9BVK6 235 aa25.58■■□□□ 1.69
ECHS1-201ENST00000368547 DCSTAMPQ9H295 470 aa25.58■■□□□ 1.69
ECHS1-201ENST00000368547 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa25.58■■□□□ 1.69
ECHS1-201ENST00000368547 ABCD4O14678 606 aa25.57■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 PRKXP51817 358 aa25.57■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 RIDAP52758 137 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa25.57■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 KCNS3Q9BQ31 491 aa25.57■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa25.56■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 HGFACQ04756 655 aa25.56■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 GHSRQ92847 366 aa25.56■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 PIK3IP1Q96FE7 263 aa25.56■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 KCNN3Q9UGI6 736 aa25.56■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 M0R135 149 aa25.55■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 DCTDP32321 178 aa25.55■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 PSMB10P40306 273 aa25.55■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 TPTEP56180 551 aa25.55■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 SLC3A1Q07837 685 aa25.55■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 NAA40Q86UY6 237 aa25.55■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF799Q96GE5 643 aa25.55■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 SERPINA3P01011 423 aa25.55■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 ACSM4P0C7M7 580 aa25.55■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 COX6B1P14854 86 aa25.55■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 COL8A1P27658 744 aa25.55■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 SLC6A9P48067 706 aa25.55■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 CX3CR1P49238 355 aa25.55■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 CCR9P51686 369 aa25.55■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF283Q8N7M2 679 aa25.55■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 C4orf45Q96LM5 186 aa25.55■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 NIPAL2Q9H841 368 aa25.55■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 CADP27708 2225 aa25.55■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa25.54■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 GABRPO00591 440 aa25.54■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 SC5DO75845 299 aa25.54■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 CD3EP07766 207 aa25.54■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 TGFBR1P36897 503 aa25.54■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 WNT5AP41221 380 aa25.54■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF544Q6NX49 715 aa25.54■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 RADILQ96JH8 1075 aa25.54■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 KCTD7Q96MP8 289 aa25.54■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 HS3ST6Q96QI5 342 aa25.54■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 RNF167Q9H6Y7 350 aa25.54■■□□□ 1.68
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ECHS1-201ENST00000368547 SLC22A25Q6T423 547 aa25.53■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM91Q6ZNR0 172 aa25.53■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 OR2G2Q8NGZ5 317 aa25.53■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 OR51B6Q9H340 312 aa25.53■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 SLC2A1P11166 492 aa25.52■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 SERPINB10P48595 397 aa25.52■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 DGUOKQ16854 277 aa25.52■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 YIF1BQ5BJH7 314 aa25.52■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 C22orf42Q6IC83 251 aa25.52■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 ADAM5Q6NVV9 412 aa25.52■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 DRAM2Q6UX65 266 aa25.52■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF101Q8IZC7 436 aa25.52■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 ABHD4Q8TB40 342 aa25.52■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 BRD7Q9NPI1 651 aa25.52■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 FRRS1LQ9P0K9 344 aa25.52■■□□□ 1.68
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ECHS1-201ENST00000368547 A6NNC1 897 aa25.52■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 APOC1P02654 83 aa25.52■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 FAM157BP0CG42 384 aa25.52■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 PAMR1Q6UXH9 720 aa25.52■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 PHYHIPQ92561 330 aa25.52■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF281Q9Y2X9 895 aa25.52■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 RNF115Q9Y4L5 304 aa25.52■■□□□ 1.68
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM212A6NML5 194 aa25.51■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa25.51■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 R4GMQ9 66 aa25.51■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 PKDREJQ9NTG1 2253 aa25.5■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa25.5■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 OR4C45A6NMZ5 311 aa25.5■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 ICMTO60725 284 aa25.5■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 GATBO75879 557 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 ZFPL1O95159 310 aa25.5■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 NGFP01138 241 aa25.5■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 IL1AP01583 271 aa25.5■■□□□ 1.67
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