RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368215.7

PTPRK-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 4,651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-206ENST00000368215 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa7.56□□□□□ -1.2
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PTPRK-206ENST00000368215 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRK-206ENST00000368215 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRK-206ENST00000368215 RAB11FIP2Q7L804 512 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRK-206ENST00000368215 SLC51BQ86UW2 128 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRK-206ENST00000368215 GVQW1Q8N7I0 195 aa7.56□□□□□ -1.2
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PTPRK-206ENST00000368215 AKR1C1Q04828 323 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRK-206ENST00000368215 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
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PTPRK-206ENST00000368215 MCHR2Q969V1 340 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
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PTPRK-206ENST00000368215 C12orf49Q9H741 205 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRK-206ENST00000368215 CNTD2Q9H8S5 307 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRK-206ENST00000368215 C12orf10Q9HB07 376 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRK-206ENST00000368215 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa7.56□□□□□ -1.2
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PTPRK-206ENST00000368215 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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PTPRK-206ENST00000368215 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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PTPRK-206ENST00000368215 ZNF695Q8IW36 515 aa7.55□□□□□ -1.2
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PTPRK-206ENST00000368215 UCK1Q9HA47 277 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRK-206ENST00000368215 FAM86C1Q9NVL1 165 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRK-206ENST00000368215 SDHAF2Q9NX18 166 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRK-206ENST00000368215 PDCD1Q15116 288 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRK-206ENST00000368215 OR2AE1Q8NHA4 323 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRK-206ENST00000368215 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRK-206ENST00000368215 SCARB1Q8WTV0 552 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRK-206ENST00000368215 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa7.55□□□□□ -1.2
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