RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366934.3

GPATCH2-201, Transcript of G-patch domain containing 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GPATCH2, Length 3,218 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPATCH2-201ENST00000366934 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa9.77□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 SLAMF6Q96DU3 332 aa9.77□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 TCTN2Q96GX1 697 aa9.77□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 SLC46A1Q96NT5 459 aa9.77□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 OBP2AQ9NY56 170 aa9.77□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa9.77□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 ZNF175Q9Y473 711 aa9.77□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 ABCA7Q8IZY2 2146 aa9.77□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 OR5K4A6NMS3 321 aa9.77□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 RHPN2P1A8MT19 583 aa9.77□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 A8MVM7 634 aa9.77□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 CRYBA1P05813 215 aa9.77□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 IGHV4-34P06331 123 aa9.77□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 PPT1P50897 306 aa9.77□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 SWI5Q1ZZU3 235 aa9.77□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 MICBQ29980 383 aa9.77□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 ZNF260Q3ZCT1 412 aa9.77□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 OR1M1Q8NGA1 313 aa9.77□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 OR10Z1Q8NGY1 313 aa9.77□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 MRGPRFQ96AM1 343 aa9.77□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 RAB22AQ9UL26 194 aa9.77□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 MEGF11A6BM72 1044 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 F5H5K5 113 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 ZNF217O75362 1048 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 TXNDC12O95881 172 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 CRHP06850 196 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 SERPINA2P20848 420 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 ANOS1P23352 680 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 CRABP1P29762 137 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 EFNA3P52797 238 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 MFAP5Q13361 173 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 MEF2DQ14814 521 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 KRBOX4Q5JUW0 171 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 FNDC7Q5VTL7 733 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 TMEM244Q5VVB8 128 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 BRICD5Q6PL45 260 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 FAM57BQ71RH2 274 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 SLC16A13Q7RTY0 426 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 ISOC2Q96AB3 205 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 RAB3CQ96E17 227 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 PBOV1Q9GZY1 135 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 ADAM19Q9H013 955 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 FN3KRPQ9HA64 309 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 CTSFQ9UBX1 484 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 RER1O15258 196 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 WDPCPO95876 746 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 RAB6AP20340 208 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 ASCL1P50553 236 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 SLC26A5P58743 744 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 YPEL5P62699 121 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 TEX30Q5JUR7 227 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 DRAM2Q6UX65 266 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 NAA40Q86UY6 237 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 ZNF283Q8N7M2 679 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 OR51T1Q8NGJ9 327 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 NANPQ8TBE9 248 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 MITD1Q8WV92 249 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 PIK3IP1Q96FE7 263 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 FAM117AQ9C073 453 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 G6PC2Q9NQR9 355 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 EHFQ9NZC4 300 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 KLRF1Q9NZS2 232 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 ASH2LQ9UBL3 628 aa9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 M0R036 132 aa9.75□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 PNLIPRP2P54317 469 aa9.75□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 ZNF616Q08AN1 781 aa9.75□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 FAM76BQ5HYJ3 339 aa9.75□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 CLEC18BQ6UXF7 455 aa9.75□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 OR5D14Q8NGL3 314 aa9.75□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 RNF141Q8WVD5 230 aa9.75□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 TOMM40LQ969M1 308 aa9.75□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 OR10C1Q96KK4 312 aa9.75□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 C1orf198Q9H425 327 aa9.75□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 RPS10P5Q9NQ39 176 aa9.75□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 FANCMQ8IYD8 2048 aa9.75□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa9.75□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 FAM221AA4D161 298 aa9.75□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 LINC01387J3KSC0 135 aa9.75□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 GABRR1P24046 479 aa9.75□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 SLC6A8P48029 635 aa9.75□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 PDCD1Q15116 288 aa9.75□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 SP6Q3SY56 376 aa9.75□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa9.75□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 SHEQ5VZ18 495 aa9.75□□□□□ -0.85
GPATCH2-201ENST00000366934 FAM166AQ6J272 317 aa9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms