RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365434.1

RNU6-1130P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1130, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1130P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1130P-201ENST00000365434 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 MMP11P24347 488 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 GNA11P29992 359 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 QARSP47897 775 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 PLP1P60201 277 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 ARF5P84085 180 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 HES1Q14469 280 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 ACSBG2Q5FVE4 666 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 C9orf135Q5VTT2 229 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 C22orf42Q6IC83 251 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 KCNIP4Q6PIL6 250 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 ECHDC2Q86YB7 292 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 MSRB3Q8IXL7 192 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 OR56B1Q8NGI3 324 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 OR1L1Q8NH94 360 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 OR2V1Q8NHB1 315 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 GDAP1Q8TB36 358 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 CMTM5Q96DZ9 223 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 NSMCE2Q96MF7 247 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 OR8B2Q96RD0 313 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 FAIM2Q9BWQ8 316 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 TMEM117Q9H0C3 514 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 DYRK4Q9NR20 520 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 UBQLN4Q9NRR5 601 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 BFARQ9NZS9 450 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 CLN8Q9UBY8 286 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 ANGPT4Q9Y264 503 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 LRRC42Q9Y546 428 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 POLQO75417 2590 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 PXDNLA1KZ92 1463 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 SSX5O60225 188 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 ERLIN2O94905 339 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 ETHE1O95571 254 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 MT-ND4P03905 459 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 MAS1P04201 325 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 ETS2P15036 469 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 PRKACBP22694 351 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 LIPEQ05469 1076 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 CYP24A1Q07973 514 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 TWF1Q12792 350 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 PNOCQ13519 176 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 RCAN2Q14206 197 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 Q6ZQT7 251 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 TTC25Q96NG3 672 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 PORCNQ9H237 461 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 KCNJ16Q9NPI9 418 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 CA10Q9NS85 328 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 SPTBN2O15020 2390 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 CDHR2Q9BYE9 1310 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 LAMA1P25391 3075 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 TEX15Q9BXT5 2789 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 CADP27708 2225 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 PCNX1Q96RV3 2341 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 CFAP73A6NFT4 308 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 TNFRSF11BO00300 401 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 RDH16O75452 317 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 C2P06681 752 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 TALDO1P37837 337 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 MAP2K4P45985 399 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 YAP1P46937 504 aaKnown RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 ACADVLP49748 655 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 MESDQ14696 234 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 DGUOKQ16854 277 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 GGTA1PQ4G0N0 100 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 ZNF678Q5SXM1 525 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 PDPK2PQ6A1A2 396 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 MDP1Q86V88 176 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 ORMDL3Q8N138 153 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 Q8NAQ8 132 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 FAM184AQ8NB25 1140 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 MSANTD4Q8NCY6 345 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 OR4D6Q8NGJ1 314 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 OR51F2Q8NH61 342 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 ZNRF2Q8NHG8 242 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 RNF133Q8WVZ7 376 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 FAM3CQ92520 227 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 TNFRSF14Q92956 283 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 SERPINB12Q96P63 405 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 B9D2Q9BPU9 175 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 SAMD10Q9BYL1 202 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1130P-201ENST00000365434 MFFQ9GZY8 342 aa-0.96□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.9 ms