RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354662.5

LMO3-204, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 3,574 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-204ENST00000354662 JTBO76095 146 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 SEC11BP0C7V7 166 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 SLC35E2P0CK97 266 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 OR13C7P0DN81 318 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 ID4P47928 161 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 DCAF7P61962 342 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 COL10A1Q03692 680 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 TMEM183BQ1AE95 376 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 ARTNQ5T4W7 220 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 LEG1Q6P5S2 330 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 ARL9Q6T311 187 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 SLC26A10Q8NG04 563 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 GPR32P1Q8NGA4 272 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 SEC22AQ96IW7 307 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 SEMA3CQ99985 751 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 OR6C3Q9NZP0 311 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 FAM50BQ9Y247 325 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 MEMO1Q9Y316 297 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 MSGN1A6NI15 193 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 VSTM2BA6NLU5 285 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 HSPB2A8KAH6 182 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 FCMRO60667 390 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 DNAJB6O75190 326 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 TIAF1O95411 115 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 EFEMP2O95967 443 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 CD37P11049 281 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 THPOP40225 353 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 COMPP49747 757 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 VASPP50552 380 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 HSPB2Q16082 182 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 STEAP1BQ6NZ63 245 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 C17orf64Q86WR6 236 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 ZDHHC22Q8N966 263 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 SUMF2Q8NBJ7 301 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 ZNF519Q8TB69 540 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 TVP23CQ96ET8 276 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 APIPQ96GX9 242 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 WFDC1Q9HC57 220 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 CAPN10Q9HC96 672 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 FUT9Q9Y231 359 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 GPR52Q9Y2T5 361 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 HELZP42694 1942 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 NINQ8N4C6 2090 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 LOC730098B7Z3J9 87 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 XKRYO14609 159 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 CHRM2P08172 466 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 COX7A2P14406 83 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 RPS15P62841 145 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 FBXO47Q5MNV8 452 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 CTSL3PQ5NE16 218 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 TMEM225Q6GV28 225 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 TMEM239Q8WW34 195 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 SMIM19Q96E16 107 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 OR2V2Q96R30 315 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 YIPF1Q9Y548 306 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 RNF212BA8MTL3 300 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 CTSBP07858 339 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 VIPR2P41587 438 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 BIDP55957 195 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 IL15RAQ13261 267 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 GAS6Q14393 721 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 SLC22A6Q4U2R8 563 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 STPG1Q5TH74 334 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 NIPAL3Q6P499 406 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 TRIM40Q6P9F5 258 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 FAM220AQ7Z4H9 259 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 SLC38A9Q8NBW4 561 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 SLC6A7Q99884 636 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 RRAGCQ9HB90 399 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 BLACEA4D250 179 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 OR5B21A6NL26 309 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 LRATO95237 230 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 ZNF286BP0CG31 522 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 PPIAL4GP0DN37 164 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 EPORP19235 508 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 CTRLP40313 264 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 PNLIPRP1P54315 467 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 DECR1Q16698 335 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-204ENST00000354662 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms