RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 CMTM4Q8IZR5 234 aa7.51□□□□□ -1.21
PKHD1-201ENST00000340994 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.51□□□□□ -1.21
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PKHD1-201ENST00000340994 ZFAND5O76080 213 aa7.51□□□□□ -1.21
PKHD1-201ENST00000340994 EN2P19622 333 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PKHD1-201ENST00000340994 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PKHD1-201ENST00000340994 SYPL1Q16563 259 aa7.51□□□□□ -1.21
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PKHD1-201ENST00000340994 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
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PKHD1-201ENST00000340994 HSD17B6O14756 317 aa7.51□□□□□ -1.21
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PKHD1-201ENST00000340994 ERASQ7Z444 233 aa7.51□□□□□ -1.21
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PKHD1-201ENST00000340994 CLEC18CQ8NCF0 446 aa7.5□□□□□ -1.21
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PKHD1-201ENST00000340994 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
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PKHD1-201ENST00000340994 MZB1Q8WU39 189 aa7.5□□□□□ -1.21
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PKHD1-201ENST00000340994 WNT11O96014 354 aa7.5□□□□□ -1.21
PKHD1-201ENST00000340994 SLC6A1P30531 599 aa7.5□□□□□ -1.21
PKHD1-201ENST00000340994 VASPP50552 380 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PKHD1-201ENST00000340994 CDK5R1Q15078 307 aa7.5□□□□□ -1.21
PKHD1-201ENST00000340994 TBC1D28Q2M2D7 210 aa7.5□□□□□ -1.21
PKHD1-201ENST00000340994 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PKHD1-201ENST00000340994 OR5AU1Q8NGC0 362 aa7.5□□□□□ -1.21
PKHD1-201ENST00000340994 C19orf43Q9BQ61 176 aa7.5□□□□□ -1.21
PKHD1-201ENST00000340994 RSG1Q9BU20 258 aa7.5□□□□□ -1.21
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