RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 KIRREL2Q6UWL6 708 aa20.23■□□□□ 0.83
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PTPRM-201ENST00000332175 OR4F5Q8NH21 305 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-201ENST00000332175 OR4F4Q96R69 305 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-201ENST00000332175 SOX7Q9BT81 388 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRM-201ENST00000332175 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa20.23■□□□□ 0.83
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PTPRM-201ENST00000332175 CLCF1Q9UBD9 225 aa20.19■□□□□ 0.82
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PTPRM-201ENST00000332175 METTL15P1P0C7V9 234 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
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