RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 ICAM5Q9UMF0 924 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 SNCGO76070 127 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 IGHV3-43DP0DP04 118 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 NPY1RP25929 384 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 PYCR3Q53H96 274 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 LRRC10Q5BKY1 277 aa9.59□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 FGF14Q92915 247 aa9.59□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 OR5H6Q8NGV6 325 aa9.59□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 SLC25A22Q9H936 323 aa9.59□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 TMEM99Q8N816 258 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 RNF141Q8WVD5 230 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 NEURL3Q96EH8 262 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 DPH3Q96FX2 82 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 GPR87Q9BY21 358 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 TXNIPQ9H3M7 391 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 BCO1Q9HAY6 547 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 TSPAN12O95859 305 aa9.59□□□□□ -0.88
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CLN8-201ENST00000331222 FCN2Q15485 313 aa9.59□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 HLA-BQ31612 363 aa9.59□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ZNF766Q5HY98 468 aa9.59□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 TMEM81Q6P7N7 255 aa9.59□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 TMUB2Q71RG4 321 aa9.59□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SPACA1Q9HBV2 294 aa9.59□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 H0YIV9 168 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 PENKP01210 267 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 TCRBP04435 133 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 OR3A4PP47883 348 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 OR2B8PP59922 312 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 RELAQ04206 551 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 C3AR1Q16581 482 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SLC25A26Q70HW3 274 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 M1APQ8TC57 530 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 USP3Q9Y6I4 520 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 PAQR6Q6TCH4 344 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ZNF573Q86YE8 665 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa9.58□□□□□ -0.88
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CLN8-201ENST00000331222 SLC22A13Q9Y226 551 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SCN9AQ15858 1988 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 FGF17O60258 216 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 PIGPP57054 158 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 TPPP2P59282 170 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ERVFC1-1P60608 527 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 LRP3O75074 770 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SLCO2B1O94956 709 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 MMP11P24347 488 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 THEM4Q5T1C6 240 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 FAM219BQ5XKK7 198 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 DOK3Q7L591 496 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 OR10P1Q8NGE3 313 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 OR52I2Q8NH67 350 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 OPALINQ96PE5 141 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ZNF251Q9BRH9 671 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 BMPR1BO00238 502 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 GALMQ96C23 342 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 UBQLN3Q9H347 655 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa9.58□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa9.57□□□□□ -0.88
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CLN8-201ENST00000331222 ZNF195O14628 629 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CR2P20023 1033 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 OR1C1Q15619 314 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 C9orf50Q5SZB4 431 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 LIPNQ5VXI9 398 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 BTNL3Q6UXE8 466 aa9.57□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 PRSS35Q8N3Z0 413 aa9.57□□□□□ -0.88
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