RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 PMELP40967 661 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 ERFP50548 548 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 MAB21L1Q13394 359 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 DUSP7Q16829 419 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 RABL3Q5HYI8 236 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 LRIF1Q5T3J3 769 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC2A7Q6PXP3 512 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF144BQ7Z419 303 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 COMTD1Q86VU5 262 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 MOSPD2Q8NHP6 518 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 SORT1Q99523 831 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 PNPOQ9NVS9 261 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 THAP1Q9NVV9 213 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 BAG5Q9UL15 447 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 GMEB1Q9Y692 573 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 RYR3Q15413 4870 aa6.43□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 GGT3PA6NGU5 568 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 H0YAE9 185 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 IFNA14P01570 189 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 LCATP04180 440 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPAN19P0C672 248 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 GGT2P36268 569 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL4P36578 427 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC9A3P48764 834 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 ST3GAL3Q11203 375 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 OAFQ86UD1 273 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 SDR9C7Q8NEX9 313 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 Q8NFD4 153 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 OR8S1Q8NH09 359 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 PFN4Q8NHR9 129 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC8CQ8TDW0 803 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 SPDL1Q96EA4 605 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 MED30Q96HR3 178 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 CHID1Q9BWS9 393 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 C20orf27Q9GZN8 174 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 DNTTIP1Q9H147 329 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 RERGLQ9H628 205 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 OPA3Q9H6K4 179 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJB11Q9UBS4 358 aa6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 BHLHE40O14503 412 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 RAMP3O60896 148 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 TIPRLO75663 272 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 GRPP07492 148 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 KITP10721 976 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 IFI30P13284 250 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 CA6P23280 308 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 CRABP1P29762 137 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 CENPAP49450 140 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 GP2P55259 537 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 TPTEP56180 551 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 MPPED2Q15777 294 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 SNCBQ16143 134 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC36A3Q495N2 470 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 DMRTC1Q5HYR2 192 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 RRM2BQ7LG56 351 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 C10orf111Q8N326 155 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4C15Q8NGM1 316 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 MUC7Q8TAX7 377 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM255BQ8WV15 326 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 CAPSLQ8WWF8 208 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC7A6Q92536 515 aa6.41□□□□□ -1.38
PGGT1B-201ENST00000296642 SPTSSAQ969W0 71 aa6.41□□□□□ -1.38
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