RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287263.8

RAB11FIP1-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11FIP1, Length 6,253 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1-201ENST00000287263 CSNK1G2P78368 415 aa13.14□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 NHLH1Q02575 133 aa13.14□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 NHLH2Q02577 135 aa13.14□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 OR2AK2Q8NG84 335 aa13.14□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ASB16Q96NS5 453 aa13.14□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 NMES1Q9C002 83 aa13.14□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 RNF150Q9ULK6 438 aa13.14□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 A0A1B0GV90 55 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 A0A1W2PR80 420 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 C5orf49A4QMS7 147 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 DEGS1O15121 323 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SLC16A6O15403 523 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SPATA46Q5T0L3 261 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 RTL6Q6ICC9 239 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 DBX1A6NMT0 343 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SIAH2O43255 324 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 RPL7P18124 248 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 Q6ZS52 159 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 OR1J2Q8NGS2 313 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 GHRLQ9UBU3 117 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TAAR5O14804 337 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SOX18P35713 384 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ZNF154Q13106 437 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 PLA1AQ53H76 456 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 PLPPR2Q96GM1 343 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 MS4A8Q9BY19 250 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ZNF835Q9Y2P0 537 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 LRRC30A6NM36 301 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 PPP1CBP62140 327 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 OR2W3Q7Z3T1 314 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 OR52N5Q8NH56 324 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SOX7Q9BT81 388 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 NECAP2Q9NVZ3 263 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ETV7Q9Y603 341 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ST8SIA3O43173 380 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 KLK10O43240 276 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 CMTM4Q8IZR5 234 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ASB17Q8WXJ9 295 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SNX22Q96L94 193 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TEX37Q96LM6 180 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 UBQLN3Q9H347 655 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 R4GN57 208 aa13.13□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 GYPAP02724 150 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 CD3DP04234 171 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 HEXAP06865 529 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SLC25A4P12235 298 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 CST5P28325 142 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 PPOXP50336 477 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 LPCAT3Q6P1A2 487 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 MENTQ9BUN1 341 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 EPHX3Q9H6B9 360 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 EVA1AQ9H8M9 152 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 PAM16Q9Y3D7 125 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 MMP11P24347 488 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 HTR1FP30939 366 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 RPS27P42677 84 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 PFN3P60673 137 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 FOXK2Q01167 660 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 OR1J1Q8NGS3 322 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 FGF14Q92915 247 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 PCED1AQ9H1Q7 454 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 PLA2G3Q9NZ20 509 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ERVFC1-1P60608 527 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 CATR1Q13166 79 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SLC5A6Q9Y289 635 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SHISA8B8ZZ34 492 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 GPRIN2O60269 458 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ZNF92Q03936 586 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 OR4A47Q6IF82 309 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 OR10X1Q8NGY0 326 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SERTM1A2A2V5 107 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SLC25A6P12236 298 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 GFERP55789 205 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ROBO4Q8WZ75 1007 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 NPAS1Q99742 590 aa13.12□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa13.11□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 A0A1W2PPE2 198 aa13.11□□□□□ -0.31
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SIGLEC5O15389 551 aa13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms