RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 SRPXP78539 464 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 FNDC7Q5VTL7 733 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 SLC26A10Q8NG04 563 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 OR5M9Q8NGP3 310 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 C2orf50Q96LR7 162 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 GPR84Q9NQS5 396 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 MED29Q9NX70 200 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 EDARQ9UNE0 448 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 OR6C65A6NJZ3 312 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 SERPINE3A8MV23 424 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 CFIP05156 583 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 GNB3P16520 340 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 CNR1P21554 472 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 PEA15Q15121 130 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 BEX5Q5H9J7 111 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 NHLRC3Q5JS37 347 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZS52 159 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 CLEC1AQ8NC01 280 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 NMES1Q9C002 83 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 CDCP1Q9H5V8 836 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 ZNF286AQ9HBT8 521 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 LIPT2A6NK58 231 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 ADRA2CP18825 462 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 CEBPGP53567 150 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 MFAP5Q13361 173 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 RHBDD2Q6NTF9 364 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 NAA40Q86UY6 237 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 OR10AC1Q8NH08 325 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 MICU1Q9BPX6 476 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 RGCCQ9H4X1 137 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 NECAP2Q9NVZ3 263 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 B4GALT7Q9UBV7 327 aa7.91□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa7.9□□□□□ -1.14
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HERC3-201ENST00000264345 K7EPK0 472 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 CCSO14618 274 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 SYNGR4O95473 234 aa7.9□□□□□ -1.14
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HERC3-201ENST00000264345 EFNB2P52799 333 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 EGR4Q05215 589 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 MALLQ13021 153 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 CORO6Q6QEF8 472 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 IL34Q6ZMJ4 242 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 OR6X1Q8NH79 312 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 PP6455Q8WZ26 134 aa7.9□□□□□ -1.14
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HERC3-201ENST00000264345 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 A0A0B4J2A0 478 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 DOK2O60496 412 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 SFT2D2O95562 160 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 TSPAN15O95858 294 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 LCATP04180 440 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 CD74P04233 296 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 IGKV3-11P04433 115 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 ICAM2P13598 275 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 FOLR1P15328 257 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 NPY4RP50391 375 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 HYAL4Q2M3T9 481 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 BAP18Q8IXM2 172 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 ZBTB44Q8NCP5 570 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 OR51A4Q8NGJ6 313 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 OR51A2Q8NGJ7 313 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 C10orf35Q96D05 121 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 EMC6Q9BV81 110 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
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HERC3-201ENST00000264345 SHPKQ9UHJ6 478 aa7.9□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 MPC2O95563 127 aa7.9□□□□□ -1.15
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HERC3-201ENST00000264345 CD96P40200 585 aa7.9□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 C1QL3Q5VWW1 255 aa7.9□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 PLXDC2Q6UX71 529 aa7.9□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 SCN3AQ9NY46 2000 aa7.9□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 CIB4A0PJX0 185 aa7.9□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.9□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 DCTN6O00399 190 aa7.9□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 MELTFP08582 738 aa7.9□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 CAMLGP49069 296 aa7.9□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 RHOUQ7L0Q8 258 aa7.9□□□□□ -1.15
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