RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263054.10

SORCS1-201, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SORCS1, Length 7,272 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1-201ENST00000263054 BCO1Q9HAY6 547 aa13.06□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 CORINQ9Y5Q5 1042 aa13.06□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 CASP3P42574 277 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 FCN2Q15485 313 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 SPNS3Q6ZMD2 512 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 HIST2H3AQ71DI3 136 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 PMS2P1A4D2B8 440 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 PMP22Q01453 160 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 ZNF266Q14584 549 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 C5orf46Q6UWT4 87 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 C20orf196Q8IYI0 205 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 LYZL6O75951 148 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 COX7A1P24310 79 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 AGERQ15109 404 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 ADGRG3Q86Y34 549 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 CA13Q8N1Q1 262 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 OR2AE1Q8NHA4 323 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 LPAR2Q9HBW0 351 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 TMPRSS11DO60235 418 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 CNR1P21554 472 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 OR1C1Q15619 314 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 ACSM5Q6NUN0 579 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 GABRG1Q8N1C3 465 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 OPALINQ96PE5 141 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 FLVCR2Q9UPI3 526 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 FCGR2CP31995 323 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 RPS23P62266 143 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 FBXL6Q8N531 539 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 STACQ99469 402 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 DBX1A6NMT0 343 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 C3orf80F5H4A9 247 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 MT-ATP6P00846 226 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 H3F3CQ6NXT2 135 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 ACSM6Q6P461 480 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 OR6M1Q8NGM8 313 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 BLNKQ8WV28 456 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 TEAD3Q99594 435 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 NDFIP1Q9BT67 221 aa13.05□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 SPINK4O60575 86 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 C3AR1Q16581 482 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 DRAM2Q6UX65 266 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 SLC25A26Q70HW3 274 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 ZNF573Q86YE8 665 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 OR5M8Q8NGP6 311 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 SDHAP31040 664 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 RTP5Q14D33 572 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 AGBL4Q5VU57 503 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 FAM71E1Q6IPT2 247 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 OR2L13Q8N349 312 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 A4GNTQ9UNA3 340 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 ANGPTL7O43827 346 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 GALNT16Q8N428 558 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 NKAIN3Q8N8D7 197 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 SAXO2Q658L1 398 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 OR6S1Q8NH40 331 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 COMMD5Q9GZQ3 224 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 PBOV1Q9GZY1 135 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 P4HTMQ9NXG6 502 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 ETV7Q9Y603 341 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 TSPAN12O95859 305 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 S100A4P26447 101 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 HOXD12P35452 270 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 TMUB2Q71RG4 321 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 LRRTM1Q86UE6 522 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 PRSS35Q8N3Z0 413 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 C17orf78Q8N4C9 275 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 OR5H6Q8NGV6 325 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 OR2T6Q8NHC8 308 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 CMTM3Q96MX0 182 aa13.04□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 MTNR1BP49286 362 aa13.03□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 ZNF85Q03923 595 aa13.03□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 TOR2AQ5JU69 321 aa13.03□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 RNF141Q8WVD5 230 aa13.03□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa13.03□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 TRABD2BA6NFA1 517 aa13.03□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 PIGPP57054 158 aa13.03□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 COL19A1Q14993 1142 aa13.03□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 OR52B4Q8NGK2 314 aa13.03□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 OR6K3Q8NGY3 331 aa13.03□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa13.03□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 SARAFQ96BY9 339 aa13.03□□□□□ -0.32
SORCS1-201ENST00000263054 MED17Q9NVC6 651 aa13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms