RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 LY6G6DO95868 133 aa18.91■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 PEX2P28328 305 aa18.91■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 HSD11B1P28845 292 aa18.91■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 CRYBB2P43320 205 aa18.91■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 MALLQ13021 153 aa18.91■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 TRIP10Q15642 601 aa18.91■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 OCLNQ16625 522 aa18.91■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 PGAP1Q75T13 922 aa18.91■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 BIVMQ86UB2 503 aa18.91■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 SLC35F2Q8IXU6 374 aa18.91■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 ENTHD1Q8IYW4 607 aa18.91■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 GALNT4Q8N4A0 578 aa18.91■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 OR8B4Q96RC9 309 aa18.91■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 DIRC2Q96SL1 478 aa18.91■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 SLC30A2Q9BRI3 323 aa18.91■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 PIMREGQ9BSJ6 248 aa18.91■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 CLN6Q9NWW5 311 aa18.91■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa18.91■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 GMPPBQ9Y5P6 360 aa18.91■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 CACNG2Q9Y698 323 aa18.91■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa18.9■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 H0YL77 283 aa18.9■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 MLNRO43193 412 aa18.9■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 ACHEP22303 614 aa18.9■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 RBMXP38159 391 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 DEGS2Q6QHC5 323 aa18.9■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 SSX6Q7RTT6 188 aa18.9■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 OR51G2Q8NGK0 314 aa18.9■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 RHOXF1Q8NHV9 184 aa18.9■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 CHODLQ9H9P2 273 aa18.9■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 IMPAD1Q9NX62 359 aa18.9■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
SYF2-201ENST00000236273 CD300LBA8K4G0 201 aa18.89■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 CDC14BO60729 498 aa18.89■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 APOL3O95236 402 aa18.89■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 APOC1P02654 83 aa18.89■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 CXCR4P61073 352 aa18.89■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 TMED1Q13445 227 aa18.89■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 FAM57BQ71RH2 274 aa18.89■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 ZNF679Q8IYX0 411 aa18.89■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 BHLHE23Q8NDY6 225 aa18.89■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 OR2Z1Q8NG97 314 aa18.89■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 RDH12Q96NR8 316 aa18.89■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 TTTY10Q9BZA0 68 aa18.89■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 SAP30LQ9HAJ7 183 aa18.89■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 BRD7Q9NPI1 651 aa18.89■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 DECR2Q9NUI1 292 aa18.89■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa18.89■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa18.88■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 SELEP16581 610 aa18.88■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 USF1P22415 310 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 FAM3AP98173 230 aa18.88■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 ZMAT1Q5H9K5 638 aa18.88■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 KRT77Q7Z794 578 aa18.88■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 PACRGLQ8N7B6 248 aa18.88■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 OR13G1Q8NGZ3 307 aa18.88■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 ASB17Q8WXJ9 295 aa18.88■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 ELMOD3Q96FG2 381 aa18.88■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 MNTQ99583 582 aa18.88■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 NIPAL2Q9H841 368 aa18.88■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 FAM206AQ9NX38 181 aa18.88■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 TANC2Q9HCD6 1990 aa18.88■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 J3QRE1 110 aa18.87■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 TBX1O43435 398 aa18.87■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 XRCC2O43543 280 aa18.87■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 TACSTD2P09758 323 aa18.87■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 DCTDP32321 178 aa18.87■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 TMEM33P57088 247 aa18.87■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 ZNF684Q5T5D7 378 aa18.87■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 ZNF540Q8NDQ6 660 aa18.87■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 OR52H1Q8NGJ2 320 aa18.87■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 APH1BQ8WW43 257 aa18.87■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 RFKQ969G6 155 aa18.87■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 LYZL4Q96KX0 146 aa18.87■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 APOL4Q9BPW4 351 aa18.87■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 SOX7Q9BT81 388 aa18.87■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 DCLRE1BQ9H816 532 aa18.87■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 TREM2Q9NZC2 230 aa18.87■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 DYSFO75923 2080 aa18.87■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 ZFHX3Q15911 3703 aa18.86■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 WNT9BO14905 357 aa18.86■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 ZNF254O75437 659 aa18.86■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 PNPP00491 289 aa18.86■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 HLA-DPB1P04440 258 aa18.86■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 OR2T7P0C7T2 308 aa18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms