RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 GJC3Q8NFK1 279 aa9.27□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa9.27□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 PCK2Q16822 640 aa9.27□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 C12orf73Q69YU5 71 aa9.27□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 ARSGQ96EG1 525 aa9.27□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 MARCH3Q86UD3 253 aa9.27□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 ARHGDIGQ99819 225 aa9.27□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 TFAP2EQ6VUC0 442 aa9.27□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 ZNF383Q8NA42 475 aa9.27□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 SPP1P10451 314 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 FAM3CQ92520 227 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 CA14Q9ULX7 337 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 BATF2Q8N1L9 274 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 OR51H1Q8NH63 302 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 KCNJ15Q99712 375 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 PIGPP57054 158 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 NR0B2Q15466 257 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 EXD3Q8N9H8 876 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 LIPHQ8WWY8 451 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 HDAC8Q9BY41 377 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 TNFSF4P23510 183 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 ZNF628Q5EBL2 1059 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 IL22RA1Q8N6P7 574 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 MYOTQ9UBF9 498 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 ZNF320A2RRD8 509 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 GPR31O00270 319 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 TSPAN12O95859 305 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 PGFP49763 221 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 ZNF787Q6DD87 383 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 CATSPERDQ86XM0 798 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 CTSFQ9UBX1 484 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 DSCR3O14972 297 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 GDF1P27539 372 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 ELFN2Q5R3F8 820 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 CXorf58Q96LI9 332 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 DOK3Q7L591 496 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 SPICQ8N5J4 248 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 ZNRF4Q8WWF5 429 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 ARRDC3Q96B67 414 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 IL23AQ9NPF7 189 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 RNF150Q9ULK6 438 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 PRAMEF20Q5VT98 475 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 MSRB3Q8IXL7 192 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 C9orf62Q8N4C0 152 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 OPRM1P35372 400 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 INSL4Q14641 139 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 PLXDC2Q6UX71 529 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 BCL2L10Q9HD36 194 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 TMEM30AQ9NV96 361 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 PLSCR5A0PG75 271 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 TMEM229BQ8NBD8 167 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 IL17BQ9UHF5 180 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 RAB27BO00194 218 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 ATF1P18846 271 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 TRIM61Q5EBN2 209 aa9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 XRCC2O43543 280 aa9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 GLSO94925 669 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 CST5P28325 142 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 RAG2P55895 527 aa9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 PKIAP61925 76 aa9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 NHLRC1Q6VVB1 395 aa9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 LHX4Q969G2 390 aa9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 CMBLQ96DG6 245 aa9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 OR5V1Q9UGF6 321 aa9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 C2orf72A6NCS6 295 aa9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 PMCHP20382 165 aa9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 LYPD8Q6UX82 237 aa9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 ZNF66Q6ZN08 573 aa9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 WNK2Q9Y3S1 2297 aa9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 SLC6A1P30531 599 aa9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 NCR3LG1Q68D85 454 aa9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 GPX8Q8TED1 209 aa9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 NXPH2O95156 264 aa9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 IGLV3-25P01717 112 aa9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 OR51E1Q8TCB6 317 aa9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 HIST1H3AP68431 136 aa9.25□□□□□ -0.93
TTL-201ENST00000233336 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms