RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 RAB1AP62820 205 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 HIST3H3Q16695 136 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 ALKBH6Q3KRA9 238 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 GDPD3Q7L5L3 318 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 CATSPERDQ86XM0 798 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM104Q8NE00 496 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 MAFIPQ8WZ33 124 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 IP6K3Q96PC2 410 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 PRRX2Q99811 253 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 JAM3Q9BX67 310 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 INPP5EQ9NRR6 644 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 GPR173Q9NS66 373 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 V9GY05 133 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 CIB4A0PJX0 185 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 GJE1A6NN92 205 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF878C9JN71 531 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 PROB1E7EW31 1015 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 CYTIPO60759 359 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 IGHMP01871 453 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 BEST4Q8NFU0 473 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 OR8S1Q8NH09 359 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 NTNG2Q96CW9 530 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM38BQ9NVV0 291 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 PEX16Q9Y5Y5 336 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 R4GMQ9 66 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 A0A1B0GTI1 187 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 PFDN1O60925 122 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 IL18BPO95998 194 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 POU3F4P49335 361 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 EGR3Q06889 387 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 RGS21Q2M5E4 152 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 TEX30Q5JUR7 227 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 OIT3Q8WWZ8 545 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 PLEKHA1Q9HB21 404 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 NLKQ9UBE8 527 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 TBC1D24Q9ULP9 559 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 HHLA2Q9UM44 414 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 SPATA2Q9UM82 520 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 WASF3Q9UPY6 502 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 SULT1C4O75897 302 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 ARL6IP5O75915 188 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 VAMP5O95183 116 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 EVX1P49640 407 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF84P51523 738 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF92Q03936 586 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 ACSM1Q08AH1 577 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 VHLLQ6RSH7 139 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 SEM1Q6ZVN7 128 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF610Q8N9Z0 462 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 SYNPRQ8TBG9 265 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 SLC25A38Q96DW6 304 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 GPER1Q99527 375 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 NICN1Q9BSH3 213 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 SRRQ9GZT4 340 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 NIPAL2Q9H841 368 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 DKK4Q9UBT3 224 aa5.74□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 TRAV6A0A075B6T7 132 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 TFF1P04155 84 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 YES1P07947 543 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 HCKP08631 526 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 OR3A4PP47883 348 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 NUBP1P53384 320 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 TAS2R43P59537 309 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 ROM1Q03395 351 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 C2orf76Q3KRA6 126 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM255AQ5JRV8 349 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 SCMH1Q96GD3 660 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 WNT5BQ9H1J7 359 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 CNTD2Q9H8S5 307 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 FAM221AA4D161 298 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 TTLL8A6PVC2 850 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 NOTOA8MTQ0 251 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 HSPB6O14558 160 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 UPK1BO75841 260 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 AGTR1P30556 359 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 CCR6P51684 374 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 MAP2K6P52564 334 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 UBE2V2Q15819 145 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 YIF1BQ5BJH7 314 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF627Q7L945 461 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 LRRTM1Q86UE6 522 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 GJC3Q8NFK1 279 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 SGK3Q96BR1 496 aa5.73□□□□□ -1.49
CNIH1-201ENST00000216416 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms