RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638481.1

SPIN3-208, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,050 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-208	ENST00000638481	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF69	Q9UC07	566 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	PRELID1	Q9Y255	219 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	PRSS37	A4D1T9	235 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	PRR32	B1ATL7	298 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	TNFSF11	O14788	317 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	UPK3A	O75631	287 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	REN	P00797	406 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	SDHB	P21912	280 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC35A1	P78382	337 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	LINC00303	Q3SY05	128 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF626	Q68DY1	528 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	GGN	Q86UU5	652 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF511	Q8NB15	262 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	PLSCR5	A0PG75	271 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	AQP7P3	A6NL99	342 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	HSPB2	A8KAH6	182 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	CD46	P15529	392 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	MAGEA5	P43359	124 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	STAR	P49675	285 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	GFRA1	P56159	465 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	HSPB2	Q16082	182 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF766	Q5HY98	468 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	LIPN	Q5VXI9	398 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	CDC20B	Q86Y33	519 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	THEM6	Q8WUY1	208 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	THRSP	Q92748	146 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	REG4	Q9BYZ8	158 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	CACNA1G	O43497	2377 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	TRIM77	I1YAP6	450 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481		L7N2F9	121 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	ABHD16A	O95870	558 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	ALDOB	P05062	364 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	ZP3	P21754	424 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	MAGEB1	P43366	347 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	TNFSF10	P50591	281 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	H3F3A	P84243	136 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	PLGLB1	Q02325	96 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM225	Q6GV28	225 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	EMC6	Q9BV81	110 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	PPA2	Q9H2U2	334 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	IGF2R	P11717	2491 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	UBE2QL1	A1L167	161 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM212	A6NML5	194 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	GJE1	A6NN92	205 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	PHYH	O14832	338 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF254	O75437	659 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	OR2A4	O95047	310 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	GPANK1	O95872	356 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	HPN	P05981	417 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	CTLA4	P16410	223 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	DCTD	P32321	178 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	SOX2	P48431	317 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	EGR3	Q06889	387 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	UEVLD	Q8IX04	471 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		13.24	□□□□□ -0.29

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