RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 RASSF4Q9H2L5 321 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 FN3KRPQ9HA64 309 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 BTBD17A6NE02 478 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 CDC42EP2O14613 210 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 IFNW1P05000 195 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 OR8G1Q15617 311 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 CORO6Q6QEF8 472 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 RRM2BQ7LG56 351 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM122BQ7Z309 247 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 SOCS2O14508 198 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 IMPA2O14732 288 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 MALLQ13021 153 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 MEP1BQ16820 701 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 TBPL2Q6SJ96 375 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF583Q96ND8 569 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 NUAK2Q9H093 628 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 SMURF1Q9HCE7 757 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A087WUU8 490 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 G3V4G9 280 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 SDHAP31040 664 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM156AQ8NDB6 213 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 SLCO4A1Q96BD0 722 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 SNX13Q9Y5W8 968 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 LHFPL6Q9Y693 200 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GWJ7 208 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 C5orf63A6NC05 138 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 F5H5K5 113 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 FXYD1O00168 92 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 CA6P23280 308 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 SELENOWP63302 87 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 EGR3Q06889 387 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 AGBL2Q5U5Z8 902 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR139Q6DWJ6 353 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 PGM2L1Q6PCE3 622 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 PGAP1Q75T13 922 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 BTN2A1Q7KYR7 527 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 STON2Q8WXE9 905 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 C16orf95Q9H693 158 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM36Q9NQ86 728 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM220BPB1ANY3 271 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 MRASO14807 208 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 PIN1P1O15428 100 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFB2O95178 105 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 GYPAP02724 150 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 LCATP04180 440 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNMB1Q16558 191 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 DNM1P34Q6PK57 102 aa22.59■■□□□ 1.21
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CAPNS1-217ENST00000629983 ADCK1Q86TW2 530 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2T12Q8NG77 320 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 ST8SIA4Q92187 359 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 DOCK11Q5JSL3 2073 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0G2JND7 137 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 OOEPA6NGQ2 149 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFA2O43678 99 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10H3O60404 316 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 BEAN1Q3B7T3 259 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 COLCA1Q6ZS62 124 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 VMO1Q7Z5L0 202 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 PITX2Q99697 317 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM5Q9Y2B1 443 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-217ENST00000629983 A6NLC8 198 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 FFAR1O14842 300 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 FBP1P09467 338 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 ACSM4P0C7M7 580 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST1H3AP68431 136 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 COX10Q12887 443 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 PTCHD4Q6ZW05 846 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST2H3AQ71DI3 136 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00346Q8IVM7 164 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 PIP4P2Q8N4L2 257 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 TSSK2Q96PF2 358 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf123Q9NWV4 160 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 ONECUT1Q9UBC0 465 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 VPREB3Q9UKI3 123 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD61A6NGH8 418 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 DVL1O14640 695 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF682O95780 498 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 CRABP1P29762 137 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM189A2Q15884 450 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa22.56■■□□□ 1.2
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