RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592578.5

PSME3-215, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 4

Gene PSME3, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-215	ENST00000592578	LCN8	Q6JVE9	175 aa		12	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		12	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		12	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		12	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		12	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		12	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	OR2T4	Q8NH00	348 aa		12	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	DUX5	Q96PT3	197 aa		12	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	OR2V2	Q96R30	315 aa		12	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	ATF6B	Q99941	703 aa		12	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		12	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		12	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	FN3K	Q9H479	309 aa		12	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	IL20	Q9NYY1	176 aa		12	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		12	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	NOTCH1	P46531	2555 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	CLDN34	H7C241	214 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	IFNL4	K9M1U5	179 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	BHLHE40	O14503	412 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	FOXH1	O75593	365 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	GAST	P01350	101 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	ACSM4	P0C7M7	580 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	GGT2	P36268	569 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	MTNR1A	P48039	350 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	BTG1	P62324	171 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	REEP1	Q9H902	201 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	VWF	P04275	2813 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	PPIAL4D	F5H284	164 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	FAM107A	O95990	144 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	FSHB	P01225	129 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	LCAT	P04180	440 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	CRYBA1	P05813	215 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	PYCR1	P32322	319 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	TPTE	P56180	551 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	LCN2	P80188	198 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	MALL	Q13021	153 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	OR2T29	Q8NH02	315 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	LRGUK	Q96M69	825 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	DDO	Q99489	341 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	BEX1	Q9HBH7	125 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	GCM1	Q9NP62	436 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	TMEM100	Q9NV29	134 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	TMEM178B	H3BS89	294 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	MMP16	P51512	607 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	MS4A2	Q01362	244 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	ZMYND11	Q15326	602 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	MICA	Q29983	383 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	BRICD5	Q6PL45	260 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	PGAP1	Q75T13	922 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	LNX2	Q8N448	690 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	SPTSSA	Q969W0	71 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PSME3-215	ENST00000592578	MAP6	Q96JE9	813 aa		11.97	□□□□□ -0.49

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