RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 MROQ9BYG7 248 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 PTGES3LE9PB15 166 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 RGS10O43665 173 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 SULT1C4O75897 302 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 TNFAIP8O95379 198 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 PTAFRP25105 342 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 STOMP27105 288 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 DCTDP32321 178 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 OPRL1P41146 370 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 GDI2P50395 445 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 TAF13Q15543 124 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 TBC1D28Q2M2D7 210 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM108Q6UXF1 575 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT77Q7Z794 578 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF679Q8IYX0 411 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 OR10S1Q8NGN2 331 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 AKR7LQ8NHP1 331 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 SPTSSAQ969W0 71 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 CDCA4Q9BXL8 241 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM160Q9NX00 188 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 ERVK13-1Q9NX77 482 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 LAMP3Q9UQV4 416 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 OVOL3O00110 214 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT8P05787 483 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 H2BFMP0C1H6 154 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF83P51522 516 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 HCCSP53701 268 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF85Q03923 595 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 CDONQ4KMG0 1287 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM154Q6P9G4 183 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 PRSS48Q7RTY5 328 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM220AQ7Z4H9 259 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF584Q8IVC4 421 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 SYS1Q8N2H4 156 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC30A7Q8NEW0 376 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 SNX33Q8WV41 574 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 AMELYQ99218 206 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 TBX5Q99593 518 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNJ15Q99712 375 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 RHNO1Q9BSD3 238 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 CENPMQ9NSP4 180 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 NPAP1Q9NZP6 1156 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 M0R1B8 84 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 TACSTD2P09758 323 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 HSD11B1P28845 292 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 RIDAP52758 137 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 DNM1P46Q6ZS02 220 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 SIGLEC11Q96RL6 698 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 ALG8Q9BVK2 526 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 LPAR3Q9UBY5 353 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 IKZF2Q9UKS7 526 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 METTL15A6NJ78 407 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 J3QW42 95 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 PLAUP00749 431 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 CECR9P0C854 216 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 APEX1P27695 318 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 TPTEP56180 551 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF684Q5T5D7 378 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 ARL9Q6T311 187 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 KLHL36Q8N4N3 616 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 OR52N1Q8NH53 320 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 POM121L2Q96KW2 1035 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNS3Q9BQ31 491 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF649Q9BS31 505 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 SP140LQ9H930 580 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 CDH20Q9HBT6 801 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 ERGIC3Q9Y282 383 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM129A0AVI4 362 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 ICMTO60725 284 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 CRYAAP02489 173 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 LIMS3P0CW19 117 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 LIMS4P0CW20 117 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 CD40P25942 277 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 RGS6P49758 472 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 DRAM2Q6UX65 266 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 SSX6Q7RTT6 188 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 LHFPL3Q86UP9 236 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 RFLNBQ8N5W9 214 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 RADILQ96JH8 1075 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM204Q9BSN7 226 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa20.34■□□□□ 0.85
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