RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 PLATP00750 562 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 RPS2P15880 293 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 PMELP40967 661 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 OMPP47874 163 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 DGCR6Q14129 220 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 SEC23BQ15437 767 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 LEG1Q6P5S2 330 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 MOGAT3Q86VF5 341 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 KLBQ86Z14 1044 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 C10orf67Q8IYJ2 551 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 OR8G5Q8NG78 346 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 OR52E2Q8NGJ4 325 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 PTP4A1Q93096 173 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 SLCO4A1Q96BD0 722 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 COG8Q96MW5 612 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 GPA33Q99795 319 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 TMEM246Q9BRR3 403 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 ZNF696Q9H7X3 374 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 TMEM165Q9HC07 324 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 ATPIF1Q9UII2 106 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 TMEM5Q9Y2B1 443 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 POLR1DQ9Y2S0 133 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 IQCF6A8MYZ5 107 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 CLDN34H7C241 214 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 J3QW42 95 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 DIRAS1O95057 198 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 HLA-DPB1P04440 258 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 H1F0P07305 194 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 RAP2AP10114 183 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 ANOS1P23352 680 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 MAGEA2P43356 314 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 RGS6P49758 472 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 HIST1H3AP68431 136 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 KCNMB1Q16558 191 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 ZNF404Q494X3 552 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 FGD3Q5JSP0 725 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 GPR139Q6DWJ6 353 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 CFAP77Q6ZQR2 320 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 C9orf139Q6ZV77 190 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 HIST2H3AQ71DI3 136 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 ADCK1Q86TW2 530 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 C19orf18Q8NEA5 215 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 SLC25A28Q96A46 364 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 UPRTQ96BW1 309 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 SLC30A2Q9BRI3 323 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 CHID1Q9BWS9 393 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 IL1RAPQ9NPH3 570 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 AURKCQ9UQB9 309 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 A0A1B0GWJ7 208 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 FKBP6O75344 327 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 PPP1R3DO95685 299 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 TXNDC12O95881 172 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 MDKP21741 143 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 OMGP23515 440 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 SRP9P49458 86 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 GNB2P62879 340 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 SLC27A4Q6P1M0 643 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 LYPD2Q6UXB3 125 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 BRD3OSQ6XYD6 125 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 COLCA1Q6ZS62 124 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 RRM2BQ7LG56 351 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 CYP4Z1Q86W10 505 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 LINC00346Q8IVM7 164 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 OR13G1Q8NGZ3 307 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 PYDC1Q8WXC3 89 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 RAB40AQ8WXH6 277 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 COQ7Q99807 217 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 CDADC1Q9BWV3 514 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 NDEL1Q9GZM8 345 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 HDHD2Q9H0R4 259 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 ARMC1Q9NVT9 282 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 UNC119BA6NIH7 251 aa10.09□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 C22orf46C9J442 243 aa10.09□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 H3BNX3 289 aa10.09□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 IFNL4K9M1U5 179 aa10.09□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 FABP3P05413 133 aa10.09□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 ACSM4P0C7M7 580 aa10.09□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 PPIAL4GP0DN37 164 aa10.09□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 RHCEP18577 417 aa10.09□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 PITPNBP48739 271 aa10.09□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 CENPAP49450 140 aa10.09□□□□□ -0.79
CTIF-208ENST00000590422 IL13RA1P78552 427 aa10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms