RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575909.1

TOM1L1-222, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 3

Gene TOM1L1, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-222	ENST00000575909		G3V2T6	193 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909		K7EP13	123 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	VAMP5	O95183	116 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	PSMG1	O95456	288 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	IMPDH1	P20839	514 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZP3	P21754	424 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	MMP11	P24347	488 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	RFX3	P48380	749 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	LIM2	P55344	173 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	CLDN18	P56856	261 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM33	P57088	247 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	CD47	Q08722	323 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	BIK	Q13323	160 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR4D1	Q15615	310 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	EIPR1	Q53HC9	387 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	REEP3	Q6NUK4	255 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	MED27	Q6P2C8	311 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	CALHM1	Q8IU99	346 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	NRM	Q8IXM6	262 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	PXT1	Q8NFP0	134 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR2M7	Q8NG81	312 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	PIGX	Q8TBF5	258 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	APH1B	Q8WW43	257 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	TECTB	Q96PL2	329 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR2V2	Q96R30	315 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	DDIT4	Q9NX09	232 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	IL36G	Q9NZH8	169 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	PISD	Q9UG56	409 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	MSH6	P52701	1360 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	C9orf170	A2RU37	121 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	LRP5L	A4QPB2	252 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909		C9J4A7	227 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	FCN1	O00602	326 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	RS1	O15537	224 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	TPST1	O60507	370 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	TSPAN12	O95859	305 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	ACSM4	P0C7M7	580 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	KCNE1	P15382	129 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	BGN	P21810	368 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC6A1	P30531	599 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	GNRHR	P30968	328 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	RFC3	P40938	356 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	AQP2	P41181	271 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	RBP2	P50120	134 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC25A1	P53007	311 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	KCNJ2	P63252	427 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	IRF4	Q15306	451 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	TGIF1	Q15583	401 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	LPAL2	Q16609	132 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZBED5	Q49AG3	693 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	CDNF	Q49AH0	187 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	SPESP1	Q6UW49	350 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	LYG2	Q86SG7	212 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	SVOPL	Q8N434	492 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	MAGEB18	Q96M61	343 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	FOPNL	Q96NB1	174 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	RNF2	Q99496	336 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	MED18	Q9BUE0	208 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	BEX2	Q9BXY8	128 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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