RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR5AS1Q8N127 324 aa14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 DHRSXQ8N5I4 330 aa14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR5L1Q8NGL2 311 aa14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR2AE1Q8NHA4 323 aa14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 APH1BQ8WW43 257 aa14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 HAVCR1Q96D42 359 aa14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 AMBNQ9NP70 447 aa14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 C8orf4Q9NR00 106 aa14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 CLN6Q9NWW5 311 aa14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF319Q9P2F9 582 aa14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 LRP12Q9Y561 859 aa14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 GNAO1P09471 354 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 ATP6V1E1P36543 226 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAGEB1P43366 347 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 FBXW12Q6X9E4 464 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 SPNS3Q6ZMD2 512 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 USP51Q70EK9 711 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 FAM57BQ71RH2 274 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF525Q8N782 197 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 RFKQ969G6 155 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 RNFT2Q96EX2 444 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 APOL4Q9BPW4 351 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 RAB1BQ9H0U4 201 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 MS4A5Q9H3V2 200 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 MSL2Q9HCI7 577 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRIM64A6NGJ6 449 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRIM64BA6NI03 449 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 LYNX1G3V0Z9 82 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 J3QW42 95 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 TBX1O43435 398 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 SPRY3O43610 288 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 LILRA1O75019 489 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 LYNX1P0DP58 116 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 RAC2P15153 192 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 MTNR1AP48039 350 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 IL5RAQ01344 420 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF92Q03936 586 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF691Q5VV52 312 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 MEDAGQ5VYS4 303 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRSS57Q6UWY2 283 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 Q6ZR03 302 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 RHOUQ7L0Q8 258 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR10H4Q8NGA5 316 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 CNIH3Q8TBE1 160 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 COG8Q96MW5 612 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR8B4Q96RC9 309 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADI1Q9BV57 179 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 IKZF2Q9UKS7 526 aa14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 HIVEP1P15822 2718 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 C17orf100A8MU93 164 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 H3BSA7 217 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 WBP4O75554 376 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 NCR1O76036 304 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 ATP6V1G2O95670 118 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 HPXP02790 462 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 KITLGP21583 273 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 TUBG1P23258 451 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF81P51508 661 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCL8P80075 99 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMED1Q13445 227 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 TTC23Q5W5X9 447 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 BHLHE23Q8NDY6 225 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 SNX33Q8WV41 574 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 PPP1R14AQ96A00 147 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 TUBG2Q9NRH3 451 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 MPZL2O60487 215 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 IGHV1-46P01743 117 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 RBMXP38159 391 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 CAPGP40121 348 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 AQP4P55087 323 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 ROM1Q03395 351 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF91Q05481 1191 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 POU4F2Q12837 409 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 MALLQ13021 153 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 TNK1Q13470 666 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 MOGQ16653 247 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 TSTQ16762 297 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 SPRNQ5BIV9 151 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 DNM1P46Q6ZS02 220 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms