RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559312.5

NUMB-231, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUMB, Length 1,439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMB-231	ENST00000559312	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	MNT	Q99583	582 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	RNF121	Q9H920	327 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	RASSF1	Q9NS23	344 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	CLN6	Q9NWW5	311 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	RAB26	Q9ULW5	256 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	RTTN	Q86VV8	2226 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	CCDC182	A6NF36	153 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	TVP23A	A6NH52	213 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312		A6NNC1	897 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	SGCE	O43556	437 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	GPANK1	O95872	356 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	CRYAA	P02489	173 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	GNAO1	P09471	354 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	CECR9	P0C854	216 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	TUBA1B	P68363	451 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	TUBA4A	P68366	448 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	PSG4	Q00888	419 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	IL5RA	Q01344	420 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	BSPH1	Q075Z2	132 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	ECH1	Q13011	328 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	RAB35	Q15286	201 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	MEP1B	Q16820	701 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	LCE1D	Q5T752	114 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	TUBA1A	Q71U36	451 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	OTOS	Q8NHW6	89 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	WDR76	Q9H967	626 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		6.5	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	OR6C6	A6NF89	314 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	DPRX	A6NFQ7	191 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312		M0R1B8	84 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	RER1	O15258	196 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	SYNGR3	O43761	229 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	DOK2	O60496	412 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	ENTPD6	O75354	484 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	CLIC3	O95833	236 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	LYN	P07948	512 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	SPARC	P09486	303 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	SBK2	P0C263	348 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	PATE4	P0C8F1	98 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	APLNR	P35414	380 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	MTNR1A	P48039	350 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF83	P51522	516 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	NUDT6	P53370	316 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	CSNK2B	P67870	215 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	NAAA	Q02083	359 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	ARL9	Q6T311	187 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	ST7L	Q8TDW4	575 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	COQ7	Q99807	217 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	ATF6B	Q99941	703 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312		Q9H521	79 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	NOX3	Q9HBY0	568 aa		6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
NUMB-231	ENST00000559312	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37

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