RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	PRPS1L1	P21108	318 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	PRPH2	P23942	346 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	NOS3	P29474	1203 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	SRD5A2	P31213	254 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	GATA4	P43694	442 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	PNLIPRP2	P54317	469 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	CASP9	P55211	416 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	GFRA1	P56159	465 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	MYBPH	Q13203	477 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	SMCO1	Q147U7	214 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	PON3	Q15166	354 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	COX20	Q5RI15	118 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	UQCC3	Q6UW78	93 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	SSX9	Q7RTT3	188 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	FAM122B	Q7Z309	247 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	OR7G2	Q8NG99	324 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	MDFI	Q99750	246 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	FUZ	Q9BT04	418 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	IFT27	Q9BW83	186 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	EBPL	Q9BY08	206 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	PIGM	Q9H3S5	423 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	RNF122	Q9H9V4	155 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	MYNN	Q9NPC7	610 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	MPDZ	O75970	2070 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	VPS13C	Q709C8	3753 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984		A0A1W2PPE3	182 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984		A0A1W2PRB8	838 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984		E9PI62	339 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	STX11	O75558	287 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	REM1	O75628	298 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	CTAG2	O75638	210 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	UBL3	O95164	117 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	LAMP1	P11279	417 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ETFA	P13804	333 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF44	P15621	663 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	NDUFB7	P17568	137 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	CTSS	P25774	331 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	LAP3	P28838	519 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	MPI	P34949	423 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	H2BFS	P57053	126 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	OR10A3	P58181	314 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	PSG6	Q00889	435 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	RAB40B	Q12829	278 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	MISP	Q8IVT2	679 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ELOA3	Q8NG57	546 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	STK35	Q8TDR2	534 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	FAM222B	Q8WU58	562 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	RNFT2	Q96EX2	444 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	C14orf144	Q96I85	54 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ASB6	Q9NWX5	421 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	C9orf170	A2RU37	121 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	COLCA2	A8K830	154 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	C5orf58	C9J3I9	102 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	LRRN3	E7EW58	273 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	PHYH	O14832	338 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	SLC31A2	O15432	143 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	HCRTR2	O43614	444 aa		5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	BMP5	P22003	454 aa		5.75	□□□□□ -1.49

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