RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	TECTB	Q96PL2	329 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	TBX15	Q96SF7	602 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF879	B4DU55	563 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	TXNDC12	O95881	172 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	SERPINA1	P01009	418 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	ACSM4	P0C7M7	580 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	CD200	P41217	278 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	OMP	P47874	163 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	BPIFB3	P59826	476 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	LIPE	Q05469	1076 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	RRM2B	Q7LG56	351 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM86B	Q8N661	226 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	MMP27	Q9H306	513 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	PLXNB1	O43157	2135 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931		F5H5K5	113 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931		M0QZ24	198 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	P2RY10	O00398	339 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	NME4	O00746	187 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	FCN3	O75636	299 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	TOX4	O94842	621 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	PPP1R3D	O95685	299 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	ANOS1	P23352	680 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	NPY4R	P50391	375 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	SEC23B	Q15437	767 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	OR6V1	Q8N148	313 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	ERGIC1	Q969X5	290 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	WDFY2	Q96P53	400 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	PKP2	Q99959	881 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	SIRPD	Q9H106	197 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	MRGBP	Q9NV56	204 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	B9D1	Q9UPM9	204 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	RNF114	Q9Y508	228 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A1W2PRQ8	180 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	C3orf80	F5H4A9	247 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	GPR137B	O60478	399 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	IGHV4-59	P01825	116 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	LCAT	P04180	440 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	NCK1	P16333	377 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	CA6	P23280	308 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	CRABP1	P29762	137 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	GSK3B	P49841	420 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	RPS6KA3	P51812	740 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	DGCR6	Q14129	220 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	FGD3	Q5JSP0	725 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	PGAP1	Q75T13	922 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	LINC01006	Q8NI28	216 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	DYRK2	Q92630	601 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	PITX2	Q99697	317 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	ATF6B	Q99941	703 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	ARMCX1	Q9P291	453 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	RNF7	Q9UBF6	113 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LETMD1-231	ENST00000551931	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		10.4	□□□□□ -0.74

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