RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550846.5

PFDN5-211, Transcript of prefoldin subunit 5, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PFDN5, Length 392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5-211ENST00000550846 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 CCDC80Q76M96 950 aa6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 OAFQ86UD1 273 aa6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 C1QL4Q86Z23 238 aa6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 LRRC75AQ8NAA5 344 aa6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 RASD2Q96D21 266 aa6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 Q96M85 177 aa6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 ZNF583Q96ND8 569 aa6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 TMEM246Q9BRR3 403 aa6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 ANKRD60Q9BZ19 345 aa6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 IL19Q9UHD0 177 aa6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 IL20RAQ9UHF4 553 aa6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 POLR1DQ9Y2S0 133 aa6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 DPPA5A6NC42 116 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 A6NIZ1 184 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 NPIPB13A6NJU9 1138 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 POM121CA8CG34 1229 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 NPIPB4C9JG80 1138 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 H0YAE9 185 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 CXCR6O00574 342 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 XKRYO14609 159 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 CDC42EP2O14613 210 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 SURF4O15260 269 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 SLC16A7O60669 478 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 ICMTO60725 284 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 TIPRLO75663 272 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 CRYBA1P05813 215 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 SFTPBP07988 381 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 CTLA4P16410 223 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 KITLGP21583 273 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 PITPNBP48739 271 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 RAP1BP61224 184 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 RAP1AP62834 184 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 RELBQ01201 579 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 PAX2Q02962 417 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 SCRN3Q0VDG4 424 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 ST3GAL3Q11203 375 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 RFX4Q33E94 735 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 ZNF730Q6ZMV8 503 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 CALHM3Q86XJ0 350 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 PDZD9Q8IXQ8 264 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 LIPHQ8WWY8 451 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 FAM162AQ96A26 154 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 UPRTQ96BW1 309 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 HAVCR1Q96D42 359 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 PRRC1Q96M27 445 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 TECTBQ96PL2 329 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 OR8B2Q96RD0 313 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 CIB1Q99828 191 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 CHIAQ9BZP6 476 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 SYT4Q9H2B2 425 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 TMEM165Q9HC07 324 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 A4GNTQ9UNA3 340 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 C22orf46C9J442 243 aa6.68□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 CLDN34H7C241 214 aa6.68□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 SOCS2O14508 198 aa6.68□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 MLNRO43193 412 aa6.68□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 ZNF682O95780 498 aa6.68□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 PLATP00750 562 aa6.68□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 IFNA14P01570 189 aa6.68□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 COX5BP10606 129 aa6.68□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 MYF6P23409 242 aa6.68□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 PMELP40967 661 aa6.68□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 SRP9P49458 86 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 KRTAP10-3P60369 221 aa6.68□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 AQP6Q13520 282 aa6.68□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 FHL1Q13642 323 aa6.68□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 GK3PQ14409 553 aa6.68□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.68□□□□□ -1.34
PFDN5-211ENST00000550846 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.6 ms