RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 SPTSSAQ969W0 71 aa15□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 SLAMF6Q96DU3 332 aa15□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 SHARPINQ9H0F6 387 aa15□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 IL19Q9UHD0 177 aa15□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 B4DSR2 109 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 MLNRO43193 412 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 LCATP04180 440 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 TNFSF4P23510 183 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 DAPP51397 102 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 ATP6AP1Q15904 470 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 CR1LQ2VPA4 569 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 C1orf146Q5VVC0 180 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 TMEM236Q5W0B7 351 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 TIGD4Q8IY51 512 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 OR10AD1Q8NGE0 317 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 OR5K1Q8NHB7 308 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 DNAJC9Q8WXX5 260 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 OTULINQ96BN8 352 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 OR2V2Q96R30 315 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 INTS14Q96SY0 518 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 COPS4Q9BT78 406 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 BEX2Q9BXY8 128 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 ZNF665Q9H7R5 613 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 ZNF878C9JN71 531 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 H0YL77 283 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 IGHV2-5P01817 119 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 PAICSP22234 425 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 GSTT1P30711 240 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 SLC3A1Q07837 685 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 PLBD1Q6P4A8 553 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 DRAM2Q6UX65 266 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 ASRGL1Q7L266 308 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 DPY19L4Q7Z388 723 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 PARP8Q8N3A8 854 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 ZNF283Q8N7M2 679 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 BHLHE23Q8NDY6 225 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 OR6N2Q8NGY6 317 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 RAB1CQ92928 201 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 TIMD4Q96H15 378 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 SIGLEC11Q96RL6 698 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 KCNJ15Q99712 375 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 OR51V1Q9H2C8 321 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 TMEM106BQ9NUM4 274 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 KIF17Q9P2E2 1029 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 MXRA5Q9NR99 2828 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 PRODHO43272 600 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 IGHV2-70P01814 119 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 HMGN1P05114 100 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 MSMBP08118 114 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 SELEP16581 610 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 TNFRSF1AP19438 455 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 SLC2A5P22732 501 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 SLC6A9P48067 706 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 PRKXP51817 358 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 ZNF92Q03936 586 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 MALLQ13021 153 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 SPATC1Q76KD6 591 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 BBS1Q8NFJ9 593 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 OR13G1Q8NGZ3 307 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 OR2AE1Q8NHA4 323 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 RNF133Q8WVZ7 376 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 MEGF10Q96KG7 1140 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 AMELYQ99218 206 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 LPAR2Q9HBW0 351 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 CENPMQ9NSP4 180 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 AP4S1Q9Y587 144 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 SELENOFO60613 162 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 SLC2A1P11166 492 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 MMP16P51512 607 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 CRISP1P54107 249 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 PGAP1Q75T13 922 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 GLCCI1Q86VQ1 547 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 CPOQ8IVL8 374 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 RAB39BQ96DA2 213 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 ABHD6Q9BV23 337 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 GCM1Q9NP62 436 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 NPTNQ9Y639 398 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-219ENST00000550655 F5H5P2 479 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-219ENST00000550655 MITFO75030 526 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CS-219ENST00000550655 SRD5A1P18405 259 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-219ENST00000550655 HNF1AP20823 631 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-219ENST00000550655 FASP25445 335 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-219ENST00000550655 GRB2P62993 217 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CS-219ENST00000550655 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CS-219ENST00000550655 SHFQ7M4L6 423 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.9 ms