RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541869.5

POLR1B-217, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR1B, Length 5,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF620Q6ZNG0 422 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SHISA5Q8N114 240 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 CMC2Q9NRP2 79 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 FZR1Q9UM11 496 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 BDP1A6H8Y1 2624 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 A0A1W2PQD3 144 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 CTXN2P0C2S0 81 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 DAPP51397 102 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 CAV2P51636 162 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 VMA21Q3ZAQ7 101 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 FBXW12Q6X9E4 464 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 C1orf174Q8IYL3 243 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SLC29A1Q99808 456 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 BCL7BQ9BQE9 202 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 C12orf10Q9HB07 376 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF236Q9UL36 1845 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SELENOFO60613 162 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 OR4A8P0C604 315 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 PLA1AQ53H76 456 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 C17orf107Q6ZR85 190 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 AMER3Q8N944 861 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 RAB40AQ8WXH6 277 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 PERPQ96FX8 193 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 FXYD6Q9H0Q3 95 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 TERTO14746 1132 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 IGHA2P01877 340 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 CRHP06850 196 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SPI1P17947 270 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 CASP3P42574 277 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 NAAAQ02083 359 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 AKR1C1Q04828 323 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 PCGF3Q3KNV8 242 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 FAM209AQ5JX71 171 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 FBXW9Q5XUX1 488 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 TUSC5Q8IXB3 177 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 CRIPAKQ8N1N5 446 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 GPR119Q8TDV5 335 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SECTM1Q8WVN6 248 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 RDH5Q92781 318 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 RAB3CQ96E17 227 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ARSGQ96EG1 525 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 C10orf90Q96M02 699 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 OPALINQ96PE5 141 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 DLL4Q9NR61 685 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 GPR179Q6PRD1 2367 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SLC16A6O15403 523 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 PF4P02776 101 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 F2RP25116 425 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 TLE4Q04727 773 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 LTBQ06643 244 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ACTBL2Q562R1 376 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 OR52W1Q6IF63 320 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 GLCCI1Q86VQ1 547 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SSC4DQ8WTU2 575 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 PRRT1Q99946 306 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ABCG5Q9H222 651 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 DNPH1O43598 174 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 TGM6O95932 706 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF141Q15928 474 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 GSG1LQ6UXU4 331 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 B3GLCTQ6Y288 498 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 OR10J5Q8NHC4 309 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 DCUN1D4Q92564 292 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 GGHQ92820 318 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 TEAD3Q99594 435 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 GINS3Q9BRX5 216 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM208Q9BTX3 173 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 B8ZZF3 427 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SOD1P00441 154 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ALPLP05186 524 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 PTH2RP49190 550 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 DLX5P56178 289 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 CLVS2Q5SYC1 327 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 OR2T2Q6IF00 324 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 GHSRQ92847 366 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM230Q96A57 120 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ASF1BQ9NVP2 202 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 RNF24Q9Y225 148 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 A0A1W2PPV9 198 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 FOXS1O43638 330 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 MED6O75586 246 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 CD59P13987 128 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 PLA2G5P39877 138 aa9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms