RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538552.5

C16orf62-208, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, human

TSL 2

Gene C16orf62, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C16orf62-208	ENST00000538552	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	LRP12	Q9Y561	859 aa		10.43	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	TRIM64B	A6NI03	449 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552		H3BSA7	217 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552		J3QRE1	110 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552		J3QW42	95 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	ATP6V1G2	O95670	118 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	GNAO1	P09471	354 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	BMP4	P12644	408 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	KITLG	P21583	273 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	MAGEB1	P43366	347 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	SLC15A1	P46059	708 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	EFNA4	P52798	201 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	CXCR4	P61073	352 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	ROM1	Q03395	351 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	ZNF85	Q03923	595 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	ZNF92	Q03936	586 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	TMED1	Q13445	227 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	ZNF691	Q5VV52	312 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	SHE	Q5VZ18	495 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	OR2T2	Q6IF00	324 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	FAM57B	Q71RH2	274 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	KRT77	Q7Z794	578 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	OR5AS1	Q8N127	324 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	ZNF525	Q8N782	197 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	SGK3	Q96BR1	496 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552		Q96MF0	132 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	APOL4	Q9BPW4	351 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	ADI1	Q9BV57	179 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	MSL2	Q9HCI7	577 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	BRD7	Q9NPI1	651 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	CLN6	Q9NWW5	311 aa		10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	C17orf100	A8MU93	164 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	SPRY3	O43610	288 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	NCR1	O76036	304 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	PNP	P00491	289 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	HPX	P02790	462 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	LYNX1	P0DP58	116 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	RAC2	P15153	192 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	TUBG1	P23258	451 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	HSD11B1	P28845	292 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	MTNR1A	P48039	350 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	AQP4	P55087	323 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	SELENOV	P59797	346 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	ISL1	P61371	349 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	IL5RA	Q01344	420 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	ZNF91	Q05481	1191 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	RIPK1	Q13546	671 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	TTC23	Q5W5X9	447 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	USP51	Q70EK9	711 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	RFK	Q969G6	155 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	LGALS12	Q96DT0	336 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	COG8	Q96MW5	612 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	SOX7	Q9BT81	388 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	ITPR3	Q14573	2671 aa		10.4	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		10.4	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552		H0YL77	283 aa		10.4	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	TBX1	O43435	398 aa		10.4	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	MPZL2	O60487	215 aa		10.4	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	IGHV1-46	P01743	117 aa		10.4	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	OR2T7	P0C7T2	308 aa		10.4	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
C16orf62-208	ENST00000538552	COL8A2	P25067	703 aa		10.4	□□□□□ -0.74

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