RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	COMTD1	Q86VU5	262 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	PARP8	Q8N3A8	854 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	OR52J3	Q8NH60	311 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF675	Q8TD23	568 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	SDF2	Q99470	211 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	PITX2	Q99697	317 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	STARD5	Q9NSY2	213 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	CALML5	Q9NZT1	146 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	SPACA6	W5XKT8	324 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908		A0A1W2PRV1	198 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	TLCD2	A6NGC4	264 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	TRIM64B	A6NI03	449 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	VGLL3	A8MV65	326 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908		K7EQG2	157 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	BCKDK	O14874	412 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	TPST2	O60704	377 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	SDC3	O75056	442 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	CS	O75390	466 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	RDH16	O75452	317 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	CCNB2	O95067	398 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	CPNE6	O95741	557 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	IGHG1	P01857	330 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	SFTPB	P07988	381 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	HTR1A	P08908	422 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	ALOX5	P09917	674 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	CT62	P0C5K7	136 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	CT45A8	P0DMV1	189 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	CT45A9	P0DMV2	189 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	NT5E	P21589	574 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	GABRA3	P34903	492 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	GGT2	P36268	569 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	CAPZB	P47756	277 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	EMD	P50402	254 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	GFER	P55789	205 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	HSD17B7	P56937	341 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	ESRRG	P62508	458 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	SKP1	P63208	163 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	SLC35A2	P78381	396 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	BTG2	P78543	158 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	SPIB	Q01892	262 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	PMS2P3	Q13401	168 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	GPAT3	Q53EU6	434 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	XAF1	Q6GPH4	301 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	VRK2	Q86Y07	508 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	LINC00471	Q8N535	108 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	CDS1	Q92903	461 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	PTP4A1	Q93096	173 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RPS13-208	ENST00000531908	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77

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