RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531867.1

PUM1-222, Transcript of pumilio RNA binding family member 1, human

TSL 4

Gene PUM1, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM1-222	ENST00000531867	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867		J3QLI3	93 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	WNT9B	O14905	357 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	PIN1P1	O15428	100 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	FCMR	O60667	390 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	NDUFB8	O95169	186 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ANP32D	O95626	131 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ANGPTL1	O95841	491 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	CSTA	P01040	98 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	KRT6A	P02538	564 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	NGFR	P08138	427 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ANPEP	P15144	967 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	CD1D	P15813	335 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	PRKACA	P17612	351 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ELK4	P28324	431 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	OR3A3	P47888	321 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	GLIPR1	P48060	266 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	TAS2R39	P59534	338 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	HERV-K104	P63124	156 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	STX5	Q13190	355 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	MAB21L1	Q13394	359 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	OR4D1	Q15615	310 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	GPAT3	Q53EU6	434 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	SHF	Q7M4L6	423 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ANKFN1	Q8N957	763 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	NANP	Q8TBE9	248 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	RAB39B	Q96DA2	213 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	SERPINI1	Q99574	410 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	NOX4	Q9NPH5	578 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	CA10	Q9NS85	328 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	MOK	Q9UQ07	419 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	VDAC3	Q9Y277	283 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ACOT9	Q9Y305	439 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867		A0A1B0GUS0	222 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	GJE1	A6NN92	205 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	TIMM23	O14925	209 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	GPR137B	O60478	399 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	SCGN	O76038	276 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	UTS2	O95399	124 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	PSMG1	O95456	288 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	KLK1	P06870	262 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	OR4A8	P0C604	315 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	NEFH	P12036	1026 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	GP9	P14770	177 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ME2	P23368	584 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ALDH3B1	P43353	468 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	THBS3	P49746	956 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	RAB10	P61026	200 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	PHEX	P78562	749 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	BST1	Q10588	318 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	CTF1	Q16619	201 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	PCK2	Q16822	640 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	GRTP1	Q5TC63	336 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	TTC27	Q6P3X3	843 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	METTL4	Q8N3J2	472 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	CEP112	Q8N8E3	955 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	OR7G2	Q8NG99	324 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	MCHR2	Q969V1	340 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	LGALS12	Q96DT0	336 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	NAT9	Q9BTE0	207 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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