RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520371.5

CCNC-209, Transcript of cyclin C, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CCNC, Length 2,186 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-209ENST00000520371 NPAS1Q99742 590 aa14.66□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 DNAH14Q0VDD8 3507 aa14.66□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa14.66□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 H3BML4 177 aa14.66□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 BCL2L11O43521 198 aa14.66□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 CSN2P05814 226 aa14.66□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 PRKACBP22694 351 aa14.66□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 STARP49675 285 aa14.66□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 TAS2R31P59538 309 aa14.66□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 UNC119Q13432 240 aa14.66□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 TAF13Q15543 124 aa14.66□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 C3orf33Q6P1S2 294 aa14.66□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa14.66□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 SLC25A45Q8N413 288 aa14.66□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 POLR1DQ9Y2S0 133 aa14.66□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 C9orf170A2RU37 121 aa14.65□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 RLN2P04090 185 aa14.65□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 IL13RA1P78552 427 aa14.65□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 MYBPHQ13203 477 aa14.65□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 ACTBL2Q562R1 376 aa14.65□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 AWAT2Q6E213 333 aa14.65□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 TMEM71Q6P5X7 295 aa14.65□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 LHFPL5Q8TAF8 219 aa14.65□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 DNASE2BQ8WZ79 361 aa14.65□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 NUDT22Q9BRQ3 303 aa14.65□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 EMC6Q9BV81 110 aa14.65□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 RASL12Q9NYN1 266 aa14.65□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 B3GAT1Q9P2W7 334 aa14.65□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 FBXO4Q9UKT5 387 aa14.65□□□□□ -0.06
CCNC-209ENST00000520371 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 TMEM14DPA8MWL7 114 aa14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 MBTPS2O43462 519 aa14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 ZFAND5O76080 213 aa14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 CD96P40200 585 aa14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 PPP1R1AQ13522 171 aa14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 PLPPR5Q32ZL2 321 aa14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 ANGPTL5Q86XS5 388 aa14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 WDFY1Q8IWB7 410 aa14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 NOXO1Q8NFA2 376 aa14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 OR13C9Q8NGT0 318 aa14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 THAP6Q8TBB0 222 aa14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 TMEM185BQ9H7F4 350 aa14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 EMP2P54851 167 aa14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 TMEM81Q6P7N7 255 aa14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 KCNG3Q8TAE7 436 aa14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 CST11Q9H112 138 aa14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 PTGES2Q9H7Z7 377 aa14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 METTL7AQ9H8H3 244 aa14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 WIPF3A6NGB9 483 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 HRH1P35367 487 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 DLSTP36957 453 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 CASRP41180 1078 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 PRKXP51817 358 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 GABREP78334 506 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 DCDP81605 110 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 HYAL4Q2M3T9 481 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 C17orf107Q6ZR85 190 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 ZNF101Q8IZC7 436 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 OR10S1Q8NGN2 331 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 OR6X1Q8NH79 312 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 SLC22A8Q8TCC7 542 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 SELENOIQ9C0D9 397 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 SEC61A2Q9H9S3 476 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 WIF1Q9Y5W5 379 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 DCNP07585 359 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 PGA4P0DJD7 388 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 PGA3P0DJD8 388 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 NR2C1P13056 603 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 PNLIPP16233 465 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 CYCSP99999 105 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 PXDC1Q5TGL8 231 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 CCDC36Q8IYA8 594 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 GVQW1Q8N7I0 195 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 OR10K1Q8NGX5 313 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 OR51E1Q8TCB6 317 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 CMBLQ96DG6 245 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 COQ3Q9NZJ6 369 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 LHFPL6Q9Y693 200 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 MYO9BQ13459 2157 aa14.62□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa14.62□□□□□ -0.07
CCNC-209ENST00000520371 GNB3P16520 340 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms