RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510204.5

SH3BP2-217, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 3,617 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-217ENST00000510204 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
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SH3BP2-217ENST00000510204 KHKP50053 298 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 UBE2KP61086 200 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 MESP2Q0VG99 397 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 SLC22A25Q6T423 547 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 DRAM2Q6UX65 266 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 CMTM8Q8IZV2 173 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 TSLPQ969D9 159 aa10.62□□□□□ -0.71
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SH3BP2-217ENST00000510204 CHODLQ9H9P2 273 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 OR52A1Q9UKL2 312 aa10.62□□□□□ -0.71
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SH3BP2-217ENST00000510204 AQP7P3A6NL99 342 aa10.62□□□□□ -0.71
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SH3BP2-217ENST00000510204 LPAR6P43657 344 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 IQCJQ1A5X6 159 aa10.62□□□□□ -0.71
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SH3BP2-217ENST00000510204 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 HMGN2P46Q86SG4 172 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 GBGT1Q8N5D6 347 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 OR13C5Q8NGS8 318 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 PGLYRP3Q96LB9 341 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 LYSMD1Q96S90 227 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 DPEP2Q9H4A9 486 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 C12orf49Q9H741 205 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 EXO5Q9H790 373 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 IL21RQ9HBE5 538 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 BCL2L10Q9HD36 194 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 SEMA4GQ9NTN9 838 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 KLHL28Q9NXS3 571 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 COMMD9Q9P000 198 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 AIFM1O95831 613 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 RAB40ALP0C0E4 278 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 CD70P32970 193 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 ID4P47928 161 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 GPNMBQ14956 572 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 ELOBQ15370 118 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 TMEM183AQ8IXX5 376 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 DCAF4L2Q8NA75 395 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 OR9A4Q8NGU2 314 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 RAB40AQ8WXH6 277 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 SCAMP4Q969E2 229 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 CMBLQ96DG6 245 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 NRIP3Q9NQ35 241 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 PITPNC1Q9UKF7 332 aa10.61□□□□□ -0.71
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SH3BP2-217ENST00000510204 LBX1P52954 281 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 TBPL1P62380 186 aa10.61□□□□□ -0.71
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SH3BP2-217ENST00000510204 RPTNQ6XPR3 784 aa10.61□□□□□ -0.71
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SH3BP2-217ENST00000510204 H7BY64 318 aa10.6□□□□□ -0.71
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SH3BP2-217ENST00000510204 P2RX1P51575 399 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 OR12D2P58182 307 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 CBFBQ13951 182 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 DECR1Q16698 335 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
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SH3BP2-217ENST00000510204 OR11L1Q8NGX0 322 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 MED20Q9H944 212 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
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SH3BP2-217ENST00000510204 DCNP07585 359 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
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SH3BP2-217ENST00000510204 PPP2CAP67775 309 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 FCRLAQ7L513 359 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 SPRED2Q7Z698 418 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 BPIFA2Q96DR5 249 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 SLC25A38Q96DW6 304 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 DERL3Q96Q80 235 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 TIMP4Q99727 224 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 SLC25A13Q9UJS0 675 aa10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-217ENST00000510204 ANTXRLA6NF34 631 aa10.6□□□□□ -0.71
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