RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 PRTN3P24158 256 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 IL2RGP31785 369 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 CAPGP40121 348 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 CLDN17P56750 224 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 CLDN18P56856 261 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 RAB38P57729 211 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 TBPL1P62380 186 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 FGL1Q08830 312 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 CALCOCO2Q13137 446 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 CEACAM7Q14002 265 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 TFDP2Q14188 446 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 SLC25A53Q5H9E4 307 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 AADACL4Q5VUY2 407 aa3.64□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 OR9K2Q8NGE7 335 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 OR4C15Q8NGM1 316 aa3.64□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 FNDC9Q8TBE3 224 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 NT5CQ8TCD5 201 aa3.64□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 C22orf15Q8WYQ4 148 aa3.64□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 TMEM43Q9BTV4 400 aa3.64□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 OR2B2Q9GZK3 357 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 HAUS4Q9H6D7 363 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 RNF122Q9H9V4 155 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 PLEK2Q9NYT0 353 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 KLRF1Q9NZS2 232 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 MOKQ9UQ07 419 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF175Q9Y473 711 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 ETV7Q9Y603 341 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 VWFP04275 2813 aa3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 A0A0G2JN53 185 aa3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 A8MU10 97 aa3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF487B1APH4 448 aa3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 E5RI56 91 aa3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 E7EQL1 145 aa3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 G3V4G9 280 aa3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 H7C0C1 242 aa3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 PROSCO94903 275 aa3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 ETHE1O95571 254 aa3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 STAMBPO95630 424 aa3.63□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 LEG1Q6P5S2 330 aa3.63□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa3.63□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 DGCR6LQ9BY27 220 aa3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 MED20Q9H944 212 aa3.63□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa3.63□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 CHMP5Q9NZZ3 219 aa3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 STUB1Q9UNE7 303 aa3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 B9D1Q9UPM9 204 aa3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 A0A1B0GUS0 222 aa3.62□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 HACD1B0YJ81 288 aa3.62□□□□□ -1.83
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