RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504270.2

CD27-AS1-204, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 700 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-204ENST00000504270 DTX2Q86UW9 622 aa9.42□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 SLC35F2Q8IXU6 374 aa9.42□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF283Q8N7M2 679 aa9.42□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 SLC25A40Q8TBP6 338 aa9.42□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 ST7LQ8TDW4 575 aa9.42□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF799Q96GE5 643 aa9.42□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 CACNG6Q9BXT2 260 aa9.42□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 OR2J1Q9GZK6 312 aa9.42□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 TBCCD1Q9NVR7 557 aa9.42□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 AASSQ9UDR5 926 aa9.42□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 GPR160Q9UJ42 338 aa9.42□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa9.42□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 DLGAP1O14490 977 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 APOL3O95236 402 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 CLIC3O95833 236 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 APOC1P02654 83 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 MT-ND5P03915 603 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 ACSM4P0C7M7 580 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 MTNR1AP48039 350 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 MALLQ13021 153 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 TMED1Q13445 227 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 RIPK1Q13546 671 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 EFNB3Q15768 340 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 OCLNQ16625 522 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 ALKBH6Q3KRA9 238 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 LRP11Q86VZ4 500 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 ENTHD1Q8IYW4 607 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 SETD9Q8NE22 299 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 OR10H4Q8NGA5 316 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 OR10S1Q8NGN2 331 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 RNF133Q8WVZ7 376 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 ASB17Q8WXJ9 295 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 RNFT2Q96EX2 444 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 TBX5Q99593 518 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 KCNJ15Q99712 375 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 ADI1Q9BV57 179 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 BEX2Q9BXY8 128 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 TTTY10Q9BZA0 68 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 BRD7Q9NPI1 651 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 PTTG3PQ9NZH4 202 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 TAAR3PQ9P1P4 343 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 IKZF2Q9UKS7 526 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 STARD10Q9Y365 291 aa9.41□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 PLSCR5A0PG75 271 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 M0R233 179 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 PSMD9O00233 223 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 PHYHO14832 338 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 TBX1O43435 398 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 CLPTM1O96005 669 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 ADRA2AP08913 450 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 SBK2P0C263 348 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 SLC2A1P11166 492 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 ALOX5APP20292 161 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 TUBG1P23258 451 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 CAPGP40121 348 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 ALDH3B1P43353 468 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 CX3CR1P49238 355 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 EVX1P49640 407 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 GGTLC2Q14390 218 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 SWI5Q1ZZU3 235 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 MST1LQ2TV78 715 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 SLC25A30Q5SVS4 291 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 C6orf52Q5T4I8 152 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 DRAM2Q6UX65 266 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 LRRN1Q6UXK5 716 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 NAA40Q86UY6 237 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 RHOXF1Q8NHV9 184 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 SNX33Q8WV41 574 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 NRG4Q8WWG1 115 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 AMELYQ99218 206 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 MNTQ99583 582 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 MROQ9BYG7 248 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 SP140LQ9H930 580 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 ADGRL4Q9HBW9 690 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 AMBNQ9NP70 447 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 TUBG2Q9NRH3 451 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 HAO2Q9NYQ3 351 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa9.4□□□□□ -0.9
CD27-AS1-204ENST00000504270 E9PQ18 207 aa9.39□□□□□ -0.91
CD27-AS1-204ENST00000504270 H0YAE9 185 aa9.39□□□□□ -0.91
CD27-AS1-204ENST00000504270 J3QW42 95 aa9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms