RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
NELFE-210ENST00000491139 ELOVL7A1L3X0 281 aa17.21■□□□□ 0.35
NELFE-210ENST00000491139 PIN1P1O15428 100 aa17.21■□□□□ 0.35
NELFE-210ENST00000491139 SLC16A7O60669 478 aa17.21■□□□□ 0.35
NELFE-210ENST00000491139 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
NELFE-210ENST00000491139 CD200P41217 278 aa17.21■□□□□ 0.35
NELFE-210ENST00000491139 SLC9A3P48764 834 aa17.21■□□□□ 0.35
NELFE-210ENST00000491139 ARF6P62330 175 aa17.21■□□□□ 0.35
NELFE-210ENST00000491139 GNGT1P63211 74 aa17.21■□□□□ 0.35
NELFE-210ENST00000491139 PRKCDQ05655 676 aa17.21■□□□□ 0.35
NELFE-210ENST00000491139 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
NELFE-210ENST00000491139 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
NELFE-210ENST00000491139 CALHM3Q86XJ0 350 aa17.21■□□□□ 0.35
NELFE-210ENST00000491139 ZNF570Q96NI8 536 aa17.21■□□□□ 0.35
NELFE-210ENST00000491139 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
NELFE-210ENST00000491139 ECSITQ9BQ95 431 aa17.21■□□□□ 0.35
NELFE-210ENST00000491139 RNF7Q9UBF6 113 aa17.21■□□□□ 0.35
NELFE-210ENST00000491139 POLR1DQ9Y2S0 133 aa17.21■□□□□ 0.35
NELFE-210ENST00000491139 FAM96BQ9Y3D0 163 aa17.21■□□□□ 0.35
NELFE-210ENST00000491139 LGALS8O00214 317 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 ADAM20O43506 726 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 PRDX6P30041 224 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 RAD23AP54725 363 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP17.2■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 MPPED2Q15777 294 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 CYBRD1Q53TN4 286 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 RABL3Q5HYI8 236 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 ERICH5Q6P6B1 374 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 HACD2Q6Y1H2 254 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 Q6ZPA2 131 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 PDZD9Q8IXQ8 264 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 FAM156AQ8NDB6 213 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 COQ7Q99807 217 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 HDHD2Q9H0R4 259 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 SYT4Q9H2B2 425 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 PLXNB1O43157 2135 aa17.2■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 BTBD17A6NE02 478 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 TSPAN9O75954 239 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 FUT4P22083 530 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 PRSS12P56730 875 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 EGR3Q06889 387 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 FAM122BQ7Z309 247 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 CPLX4Q7Z7G2 160 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 GJC3Q8NFK1 279 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 RCN3Q96D15 328 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 TPD52L3Q96J77 140 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 ZNF583Q96ND8 569 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 FNDC11Q9BVV2 318 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 NDEL1Q9GZM8 345 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 RASSF4Q9H2L5 321 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 FN3KRPQ9HA64 309 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 SMURF1Q9HCE7 757 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 TRIM36Q9NQ86 728 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 FAM53CQ9NYF3 392 aa17.19■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 FAM220BPB1ANY3 271 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 NDUFA2O43678 99 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 COX4I1P13073 169 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 YAP1P46937 504 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 COX10Q12887 443 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 TRAM2Q15035 370 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 OR8B8Q15620 311 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 FAM189A2Q15884 450 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 KCNMB1Q16558 191 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 ZBED5Q49AG3 693 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 COLCA1Q6ZS62 124 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 REC114Q7Z4M0 266 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 PIGWQ7Z7B1 504 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 OFCC1Q8IZS5 231 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 PIP4P2Q8N4L2 257 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 FAM107BQ9H098 131 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 RHCGQ9UBD6 479 aa17.18■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 LOC100653049A0A140TA62 436 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 KRT34O76011 436 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 ECDO95905 644 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 OPN1MWP04001 364 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 OPN1MW2P0DN77 364 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 OPN1MW3P0DN78 364 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 TGFBR2P37173 567 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 GPR4P46093 362 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 GYS2P54840 703 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 HIST1H3AP68431 136 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 OR8G1Q15617 311 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 C11orf91Q3C1V1 193 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa17.17■□□□□ 0.34
NELFE-210ENST00000491139 SAMD5Q5TGI4 173 aa17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms