RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa3.55□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 TRAV39A0A0B4J263 110 aa3.55□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 TVP23AA6NH52 213 aa3.55□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 GOLGA8JA6NMD2 632 aa3.55□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 SYCE1LA8MT33 242 aa3.55□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 KLLNB2CW77 178 aa3.55□□□□□ -1.84
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CCL20-204ENST00000489160 SRP72O76094 671 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
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CCL20-204ENST00000489160 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
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CCL20-204ENST00000489160 hCG_2039718K7EN88 272 aa3.54□□□□□ -1.84
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CCL20-204ENST00000489160 SULT1C2O00338 296 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 GABRPO00591 440 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 GATCO43716 136 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 ALOX12BO75342 701 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 AQP8O94778 261 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 HPNP05981 417 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 RETP07949 1114 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 TACSTD2P09758 323 aa3.53□□□□□ -1.84
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