RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477563.6

RBBP4-211, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-211ENST00000477563 ARHGDIAP52565 204 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 BLVRAP53004 296 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 ERVS71-1P61550 626 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 HIST1H3AP68431 136 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 PSG4Q00888 419 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 MS4A2Q01362 244 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 PAX2Q02962 417 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 PAX8Q06710 450 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 BNIP1Q12981 228 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 ECH1Q13011 328 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 SGCAQ16586 387 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 TSTQ16762 297 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 MICAQ29983 383 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 SLC36A3Q495N2 470 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 PTCHD4Q6ZW05 846 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 LNX2Q8N448 690 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 LRRC18Q8N456 261 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF283Q8N7M2 679 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 CCL17Q92583 94 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 RASD2Q96D21 266 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 NRBF2Q96F24 287 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 DUX5Q96PT3 197 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 DIRC2Q96SL1 478 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 COQ7Q99807 217 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 THTPAQ9BU02 230 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 EGLN1Q9GZT9 426 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 HDHD2Q9H0R4 259 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 WNT5BQ9H1J7 359 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 SYT4Q9H2B2 425 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 NPTNQ9Y639 398 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 V9GYQ6 96 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.43□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 A0A1W2PPL8 197 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 SGCEO43556 437 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 SLC16A7O60669 478 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 NDUFA7O95182 113 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 PPP1R3DO95685 299 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 NGFP01138 241 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 CCL2P13500 99 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 NOS3P29474 1203 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 SLC25A1P53007 311 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 FLOT2Q14254 428 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF718Q3SXZ3 478 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 FBLN7Q53RD9 439 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 SPICQ8N5J4 248 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 GJC3Q8NFK1 279 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 SLC26A10Q8NG04 563 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 OR2T33Q8NG76 320 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 OR1J1Q8NGS3 322 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 NSMAFQ92636 917 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 UPRTQ96BW1 309 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 SAMD8Q96LT4 415 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 MRI1Q9BV20 369 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 IFT27Q9BW83 186 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 CHID1Q9BWS9 393 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 NUAK2Q9H093 628 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 BEX1Q9HBH7 125 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 IL20RAQ9UHF4 553 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 B9D1Q9UPM9 204 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 POMPQ9Y244 141 aa6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 COL7A1Q02388 2944 aa6.41□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 C5orf49A4QMS7 147 aa6.41□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.41□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 SOCS2O14508 198 aa6.41□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 TIMM23O14925 209 aa6.41□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 SPRY3O43610 288 aa6.41□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 DOK2O60496 412 aa6.41□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 FSTL3O95633 263 aa6.41□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 CST1P01037 141 aa6.41□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 KNG1P01042 644 aa6.41□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 IFNGP01579 166 aa6.41□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 ANXA8P13928 327 aa6.41□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 KITLGP21583 273 aa6.41□□□□□ -1.38
RBBP4-211ENST00000477563 CD80P33681 288 aa6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms