RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473069.1

RAD18-209, Transcript of RAD18, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene RAD18, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD18-209	ENST00000473069	PFN2	P35080	140 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	ERCC8	Q13216	396 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	COX18	Q8N8Q8	333 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	OR8U1	Q8NH10	309 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	RNF170	Q96K19	258 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	CTSF	Q9UBX1	484 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	ZNF879	B4DU55	563 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	C11orf94	C9JXX5	98 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	NEMF	O60524	1076 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	NMT2	O60551	498 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	ADRB3	P13945	408 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	CCNO	P22674	350 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	KIR2DS1	Q14954	304 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	LIN9	Q5TKA1	542 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	BMF	Q96LC9	184 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	ZNF681	Q96N22	645 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	MED4	Q9NPJ6	270 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	ASTN1	O14525	1302 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	PAH	P00439	452 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	BCHE	P06276	602 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	MYL9	P24844	172 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	CDKN2D	P55273	166 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	ATP5J2	P56134	94 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	PAFAH1B2	P68402	229 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	ARG2	P78540	354 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069		Q8N976	141 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	WDR31	Q8NA23	367 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	ABHD3	Q8WU67	409 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	CEP170P1	Q96L14	293 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	REEP1	Q9H902	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	NOX3	Q9HBY0	568 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		4.96	□□□□□ -1.61
RAD18-209	ENST00000473069	PINLYP	A6NC86	204 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069		M0QX08	132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	RFXANK	O14593	260 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	SLC16A7	O60669	478 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	GLA	P06280	429 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	PPIC	P45877	212 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	CACNG7	P62955	275 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	ATP6V1F	Q16864	119 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	C16orf87	Q6PH81	154 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	MKX	Q8IYA7	352 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	GPR26	Q8NDV2	337 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	NDNF	Q8TB73	568 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	RGS18	Q9NS28	235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	APOA1	P02647	267 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	TCN2	P20062	427 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	PID1	Q7Z2X4	250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	RAB43	Q86YS6	212 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	SBNO1	A3KN83	1393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069		A0A0J9YXV3	536 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	RAB19	A4D1S5	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD18-209	ENST00000473069	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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