RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 TCEAL7Q9BRU2 100 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 P2RY10O00398 339 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 CD5P06127 495 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP1-206ENST00000469947 GUSBP08236 651 aa12.09□□□□□ -0.47
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SH3BP1-206ENST00000469947 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
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SH3BP1-206ENST00000469947 SULT4A1Q9BR01 284 aa12.09□□□□□ -0.47
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SH3BP1-206ENST00000469947 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa12.09□□□□□ -0.47
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SH3BP1-206ENST00000469947 A0A1W2PRV1 198 aa12.09□□□□□ -0.47
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SH3BP1-206ENST00000469947 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
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SH3BP1-206ENST00000469947 IP6K3Q96PC2 410 aa12.08□□□□□ -0.48
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SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM240Q5SV17 173 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 AVL9Q8NBF6 648 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 KIRREL1Q96J84 757 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 C5orf66Q9H5L9 145 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 CENPMQ9NSP4 180 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 CACFD1Q9UGQ2 172 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa12.07□□□□□ -0.48
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