RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529		Q499Y3	187 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	SPATC1	Q76KD6	591 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	KRT74	Q7RTS7	529 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	TPRA1	Q86W33	373 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM203	Q969S6	136 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF799	Q96GE5	643 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	KCTD7	Q96MP8	289 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	CENPO	Q9BU64	300 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	HHLA2	Q9UM44	414 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	SVIL	O95425	2214 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	DOCK7	Q96N67	2140 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1B0GTI1	187 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF879	B4DU55	563 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529		F5H5K5	113 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	CCL21	O00585	134 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM127	O75204	238 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	RAD51D	O75771	328 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	ARL6IP5	O75915	188 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	LYZL6	O75951	148 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	IL1A	P01583	271 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	CD37	P11049	281 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	PPP3CB	P16298	524 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	AGA	P20933	346 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	BMP5	P22003	454 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	GNLY	P22749	145 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	STOM	P27105	288 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	CHRNB4	P30926	498 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	UQCRFS1	P47985	274 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	MTNR1B	P49286	362 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	GALK2	Q01415	458 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	SPSB4	Q96A44	273 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	C10orf35	Q96D05	121 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	TMED9	Q9BVK6	235 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	C16orf97	H3BN30	126 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	CD79A	P11912	226 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	PCSK6	P29122	969 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	HOXC12	P31275	282 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	HTR5A	P47898	357 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	VBP1	P61758	197 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	NCS1	P62166	190 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	SPCS2	Q15005	226 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	MDP1	Q86V88	176 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	SGK3	Q96BR1	496 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	DERL3	Q96Q80	235 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	OR10A2	Q9H208	303 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	NOX3	Q9HBY0	568 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	PIN1P1	O15428	100 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRTM2	O43300	516 aa		11.06	□□□□□ -0.64

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