RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 SMIM18P0DKX4 95 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 PSMB10P40306 273 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 UCP2P55851 309 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 MALLQ13021 153 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR50Q13585 617 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 CDK5R1Q15078 307 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 NEDD8Q15843 81 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 TIGD6Q17RP2 521 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 NCMAPQ5T1S8 102 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 BCL2L15Q5TBC7 163 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 COLCA1Q6ZS62 124 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM57BQ71RH2 274 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 CATSPERDQ86XM0 798 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 UFD1Q92890 307 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 ITFG2Q969R8 447 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 BCL2L14Q9BZR8 327 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 PBOV1Q9GZY1 135 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 COMMD4Q9H0A8 199 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 RGCCQ9H4X1 137 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 BRD7Q9NPI1 651 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF391Q9UJN7 358 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 HCFC1P51610 2035 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A0U1RQV5 110 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM212A6NML5 194 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 VSTM5A8MXK1 200 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 E9PI62 339 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 ABCD4O14678 606 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 TBX1O43435 398 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 XRCC2O43543 280 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 PLPP2O43688 288 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 GPRIN2O60269 458 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 ATE1O95260 518 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 PNPP00491 289 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC2A1P11166 492 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 CD53P19397 219 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 CELP19835 753 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 NR4A1P22736 598 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 CFL1P23528 166 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 PSMB9P28065 219 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 CALCRP30988 508 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 WNT5AP41221 380 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 RPS23P62266 143 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 HGFACQ04756 655 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 BSPH1Q075Z2 132 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 TPBGQ13641 420 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 ARMCX4Q5H9R4 360 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 WDR38Q5JTN6 314 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM244Q5VVB8 128 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 XAF1Q6GPH4 301 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC22A25Q6T423 547 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 PRSS45Q7RTY3 260 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 NAA40Q86UY6 237 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 ELMOD2Q8IZ81 293 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF676Q8N7Q3 588 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 ACBD4Q8NC06 268 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC54Q8NEL0 328 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 OR5AK2Q8NH90 309 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 ABHD4Q8TB40 342 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 MUL1Q969V5 352 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 SMIM19Q96E16 107 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 OPA3Q9H6K4 179 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 G6PC2Q9NQR9 355 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 FRRS1LQ9P0K9 344 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 KCNN3Q9UGI6 736 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 PRR14LQ5THK1 2151 aa8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1B0GVI7 797 aa8.11□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 OR4C45A6NMZ5 311 aa8.11□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 H3BSA7 217 aa8.11□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 SMPD2O60906 423 aa8.11□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 INMTO95050 263 aa8.11□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 LALBAP00709 142 aa8.11□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 TTRP02766 147 aa8.11□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 ISG15P05161 165 aa8.11□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM157BP0CG42 384 aa8.11□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 CPEP16870 476 aa8.11□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF12P17014 697 aa8.11□□□□□ -1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 KIR3DL2P43630 455 aa8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.3 ms