RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 CYP51A1Q16850 503 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 MS4A13Q5J8X5 152 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 GPRC6AQ5T6X5 926 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 ARMCX5Q6P1M9 558 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 MCOLN2Q8IZK6 566 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 PGAM4Q8N0Y7 254 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 SAMD12Q8N8I0 201 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 OR10G8Q8NGN5 311 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 OR2Y1Q8NGV0 311 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 OR56B4Q8NH76 319 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 OPTNQ96CV9 577 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 FOXC2Q99958 501 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 ELOVL4Q9GZR5 314 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 ING2Q9H160 280 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 FOLH1BQ9HBA9 442 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 EHFQ9NZC4 300 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 GNPTGQ9UJJ9 305 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 UBR2Q8IWV8 1755 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 KIF20BQ96Q89 1820 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 MSGN1A6NI15 193 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 HACD1B0YJ81 288 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 SEC14L6B5MCN3 397 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 TRMUO75648 421 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 IGHV2-5P01817 119 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 RPS17P08708 135 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 RBMY1CP0DJD4 496 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 COX5BP10606 129 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 GNB3P16520 340 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 PTGDSP41222 190 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 CRYBA2P53672 197 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 MFAP2P55001 183 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP10-3P60369 221 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 DHODHQ02127 395 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 CYP24A1Q07973 514 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 ECH1Q13011 328 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 ACTBL2Q562R1 376 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 REP15Q6BDI9 236 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 FAAP20Q6NZ36 180 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 COX15Q7KZN9 410 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 LRRC52Q8N7C0 313 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 WDR31Q8NA23 367 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 C19orf18Q8NEA5 215 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 VN1R2Q8NFZ6 395 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 OR2L5Q8NG80 312 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 OR4K2Q8NGD2 314 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 OR8K1Q8NGG5 319 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 OR51A7Q8NH64 312 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 IFT81Q8WYA0 676 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 POM121L2Q96KW2 1035 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 NICN1Q9BSH3 213 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 TRIM51Q9BSJ1 452 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 HES7Q9BYE0 225 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 ABCB10Q9NRK6 738 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 CFL2Q9Y281 166 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 PLLPQ9Y342 182 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 AUP1Q9Y679 476 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 DUOX1Q9NRD9 1551 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 CDH23Q9H251 3354 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 MUC6Q6W4X9 2439 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A0A6YYD5 115 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A1B0GTI1 187 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 SMIM23A6NLE4 172 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 TRAPPC6AO75865 159 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 UTS2O95399 124 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 HSD17B1P14061 328 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 MYOGP15173 224 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF250P15622 560 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 TFPI2P48307 235 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 TGM4P49221 684 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 SSR4P51571 173 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 BIDP55957 195 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 OR2B8PP59922 312 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 SP4Q02446 784 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 MGAT3Q09327 533 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 PGGHGQ32M88 737 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 COX19Q49B96 90 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 FRRS1Q6ZNA5 592 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 Q6ZSR9 355 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 SSX7Q7RTT5 188 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 ENTHD1Q8IYW4 607 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF491Q8N8L2 437 aa3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms