RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 OR6N2Q8NGY6 317 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5-208ENST00000459627 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5-208ENST00000459627 SLAMF6Q96DU3 332 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5-208ENST00000459627 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5-208ENST00000459627 OR2V2Q96R30 315 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5-208ENST00000459627 COPS4Q9BT78 406 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF665Q9H7R5 613 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP5-208ENST00000459627 J3QW42 95 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 BBS1Q8NFJ9 593 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 OR2AE1Q8NHA4 323 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 RAB1CQ92928 201 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 AMELYQ99218 206 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 UBAP1Q9NZ09 502 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 B4DSR2 109 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 F5H5P2 479 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 MLNRO43193 412 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 HLA-DPB1P04440 258 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 ANXA8P13928 327 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 SELEP16581 610 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 TNFSF4P23510 183 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 CDK5Q00535 292 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 TAF13Q15543 124 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 C1orf146Q5VVC0 180 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 DPY19L4Q7Z388 723 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF283Q8N7M2 679 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 ST7LQ8TDW4 575 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 SPTSSAQ969W0 71 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 TIMD4Q96H15 378 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM106BQ9NUM4 274 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 KIF17Q9P2E2 1029 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 LPAR3Q9UBY5 353 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 IQCF6A8MYZ5 107 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 SURF4O15260 269 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 SELENOFO60613 162 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 MITFO75030 526 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 IGHV2-5P01817 119 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 SRD5A1P18405 259 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 GSTT1P30711 240 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 DAPP51397 102 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 PCK2Q16822 640 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 KLHL12Q53G59 568 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 GLYATL3Q5SZD4 288 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 AMIGO2Q86SJ2 522 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 GLCCI1Q86VQ1 547 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 CPOQ8IVL8 374 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 INTS14Q96SY0 518 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 GAL3ST1Q99999 423 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 HIF1ANQ9NWT6 349 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 GLCEO94923 617 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF205O95201 554 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 MSMBP08118 114 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 SBK2P0C263 348 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 RASSF2P50749 326 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF92Q03936 586 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 MALLQ13021 153 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 TEX30Q5JUR7 227 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 PGAP1Q75T13 922 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 MEGF10Q96KG7 1140 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC30A2Q9BRI3 323 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 IL19Q9UHD0 177 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 NPTNQ9Y639 398 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 ATRQ13535 2644 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 M0R129 80 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 ATP5HO75947 161 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 PAICSP22234 425 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 TIGD4Q8IY51 512 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 OR13G1Q8NGZ3 307 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 OR5K1Q8NHB7 308 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM186Q96B77 213 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 KCNJ15Q99712 375 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 ABHD6Q9BV23 337 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 TVP23BQ9NYZ1 205 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF878C9JN71 531 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 PLPP2O43688 288 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 IFNA2P01563 188 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 IGHV2-70P01814 119 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 TNFRSF1AP19438 455 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 HNF1AP20823 631 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 CRISP1P54107 249 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms