RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457356.8

MSC-AS1-201, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MSC-AS1, Length 4,220 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-201ENST00000457356 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 TWSG1Q9GZX9 223 aa8.86□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa8.86□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 GFYI3L273 518 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 TNFSF14O43557 240 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 LY86O95711 162 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 NID1P14543 1247 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 KITLGP21583 273 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 FCARP24071 287 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 IL2RGP31785 369 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 RRADP55042 308 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 ELLP55199 621 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 CDK5R1Q15078 307 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 PMS2CLQ68D20 193 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 WDR5BQ86VZ2 330 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 OR8U1Q8NH10 309 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 RXFP4Q8TDU9 374 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 MARVELD1Q9BSK0 173 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 ULBP2Q9BZM5 246 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 TOLLIPQ9H0E2 274 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 METTL9Q9H1A3 318 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 RHOFQ9HBH0 211 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 CUTCQ9NTM9 273 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 TAS2R4Q9NYW5 299 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 OR14J1Q9UGF5 321 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 SNRPGP15A8MWD9 76 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 IGHG1P01857 330 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 DRD3P35462 400 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 GABREP78334 506 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 MFAP5Q13361 173 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 OR8G2PQ6IF36 304 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 OR1S2Q8NGQ3 325 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 OR1J2Q8NGS2 313 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 OR13C8Q8NGS7 320 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 AKR7LQ8NHP1 331 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 PSMF1Q92530 271 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 SMIM19Q96E16 107 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 MED18Q9BUE0 208 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 PRO1933Q9H354 126 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 ACAD8Q9UKU7 415 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 ZNF727A8MUV8 499 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 XRCC2O43543 280 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 KLK8O60259 260 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 SLC6A12P48065 614 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 FABP6P51161 128 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 CCL11P51671 97 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 ATP1B3P54709 279 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 BIDP55957 195 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 CYB5R2Q6BCY4 276 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 OR2T2Q6IF00 324 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 NAXDQ8IW45 347 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 FAM24BQ8N5W8 94 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 OR4S1Q8NGB4 309 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 SEH1LQ96EE3 360 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 LRRC61Q9BV99 259 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 SGPP1Q9BX95 441 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 GHITMQ9H3K2 345 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 DLL4Q9NR61 685 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 B4GALT7Q9UBV7 327 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 FAM96BQ9Y3D0 163 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 CCDC187A0A096LP49 1063 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 FAM221AA4D161 298 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 CBY3A6NI87 242 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 ARGFXA6NJG6 315 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 CYB5BO43169 146 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 EFSO43281 561 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 BCL6P41182 706 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 NXPH1P58417 271 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 ESPL1Q14674 2120 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 AGERQ15109 404 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 GUSBP11Q6P575 273 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 NHLRC1Q6VVB1 395 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 STAC2Q6ZMT1 411 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 LGI3Q8N145 548 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 GALNT16Q8N428 558 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 OR51B4Q9Y5P0 310 aa8.85□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 MED12Q93074 2177 aa8.84□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 OR6C68A6NDL8 312 aa8.84□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 SUSD5O60279 629 aa8.84□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 PRSS23O95084 383 aa8.84□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 P04436 131 aa8.84□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 CHRM2P08172 466 aa8.84□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 LIMS3P0CW19 117 aa8.84□□□□□ -0.99
MSC-AS1-201ENST00000457356 LIMS4P0CW20 117 aa8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms