RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 NOS3P29474 1203 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 GGT2P36268 569 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 PITPNBP48739 271 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 SMIM11AP58511 58 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 GNB2P62879 340 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 ECH1Q13011 328 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC9A3R2Q15599 337 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF181Q2M3W8 571 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF404Q494X3 552 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC36A3Q495N2 470 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 COLCA1Q6ZS62 124 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 NAA40Q86UY6 237 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 C1orf87Q8N0U7 546 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 C19orf18Q8NEA5 215 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 RAB40AQ8WXH6 277 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC25A28Q96A46 364 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 SLCO4A1Q96BD0 722 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 PYURFQ96I23 114 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 PLEKHA8Q96JA3 519 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 ATF6BQ99941 703 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 CDADC1Q9BWV3 514 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 MYLK2Q9H1R3 596 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 UFSP2Q9NUQ7 469 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 NOTCH1P46531 2555 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAV40A0A0B4J280 105 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A1B0GWJ7 208 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM20BO75063 409 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 HLA-DQA2P01906 255 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 PPIAL4GP0DN37 164 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 IRF2P14316 349 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 CPT2P23786 658 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 PRDX6P30041 224 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 GATA4P43694 442 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 MTNR1AP48039 350 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 MALLQ13021 153 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 MAB21L1Q13394 359 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 LYPD2Q6UXB3 125 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 PGAP1Q75T13 922 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 NLRC3Q7RTR2 1065 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 ZBTB46Q86UZ6 589 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 SDR9C7Q8NEX9 313 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 OR8B3Q8NGG8 313 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 OR11L1Q8NGX0 322 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 Q8TCH9 128 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 UPRTQ96BW1 309 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 MAP6Q96JE9 813 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 OR8B2Q96RD0 313 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM107BQ9H098 131 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 GORASP2Q9H8Y8 452 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 CLN8Q9UBY8 286 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 TMCC3Q9ULS5 477 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 DOCK11Q5JSL3 2073 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 CLDN34H7C241 214 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 ARPC2O15144 300 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 IDH3BO43837 385 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 FSTL3O95633 263 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 PLATP00750 562 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 CA6P23280 308 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 ANOS1P23352 680 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 RRM2P31350 389 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 PYCR1P32322 319 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 IFNGR2P38484 337 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 CD200P41217 278 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 RPS27P42677 84 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 GSSP48637 474 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 TPTEP56180 551 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 OR8G1Q15617 311 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 MPPED2Q15777 294 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 PRR31Q5SQ13 230 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 BRD3OSQ6XYD6 125 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF620Q6ZNG0 422 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 DCDC5Q6ZRR9 648 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 FITM2Q8N6M3 262 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 CYB561A3Q8NBI2 242 aa8.59□□□□□ -1.03
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