RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 PARP11Q9NR21 331 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-209ENST00000442510 SLC45A2Q9UMX9 530 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRC-209ENST00000442510 A0A0G2JMM0 328 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PPB8 328 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 KIR3DP1A8MWS1 328 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 G3V2L1 256 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 GRM6O15303 877 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CFIP05156 583 aa5.09□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 LINC00303Q3SY05 128 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 METTL7BQ6UX53 244 aa5.09□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 TMEM189A5PLL7 270 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 K7EP13 123 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 GPANK1O95872 356 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 HIST1H2BJP06899 126 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 TDGF1P13385 188 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 HIST1H2BOP23527 126 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 HIST1H2BBP33778 126 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 SLC6A9P48067 706 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 RAC3P60763 192 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 C1QTNF8P60827 252 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 HIST1H2BCP62807 126 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 GAGE2BQ13066 116 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 TESK1Q15569 626 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 HIST2H2BEQ16778 126 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 OR5K2Q8NHB8 316 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 NTNG2Q96CW9 530 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 RNF122Q9H9V4 155 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 SLC6A13Q9NSD5 602 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 FRS3O43559 492 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 HTR1AP08908 422 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 SHC1P29353 583 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 DAP3P51398 398 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 SLC7A9P82251 487 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 FOXK2Q01167 660 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 FBXW9Q5XUX1 488 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 C12orf42Q96LP6 360 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 MFSD1Q9H3U5 465 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CLCF1Q9UBD9 225 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ST3GAL6Q9Y274 331 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 V9GY05 133 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-209ENST00000442510 I3L1I5 382 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 CLDN5O00501 218 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 NDUFB6O95139 128 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 DDAH2O95865 285 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD34CP0C6C1 535 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF28P17035 718 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 WDR5P61964 334 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 HSD11B2P80365 405 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-209ENST00000442510 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
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