RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.55□□□□□ -1.2
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RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf105O95561 183 aa7.54□□□□□ -1.2
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RABGEF1-203ENST00000439720 AK1P00568 194 aa7.54□□□□□ -1.2
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RABGEF1-203ENST00000439720 Q499Y3 187 aa7.54□□□□□ -1.2
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RABGEF1-203ENST00000439720 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa7.54□□□□□ -1.2
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RABGEF1-203ENST00000439720 OR13C7P0DN81 318 aa7.54□□□□□ -1.2
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RABGEF1-203ENST00000439720 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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RABGEF1-203ENST00000439720 OR1N1Q8NGS0 311 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 UBE2E3Q969T4 207 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR92Q96MX6 357 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 SGPP1Q9BX95 441 aa7.53□□□□□ -1.2
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RABGEF1-203ENST00000439720 METTL7AQ9H8H3 244 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 PRSS16Q9NQE7 514 aa7.53□□□□□ -1.2
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